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rnaseq-chr22
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2021-03-06
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Gitpod RNAseq STAR管线-Chr22 Simulado 预先安装 brew install r 下载dos Apss(STAR e RSEM) 阅读后请参阅STAR e RSEM para alinhamento e contagem。 执行脚本run.down.apps.sh sh run.down.apps.sh 推荐给chr22的chr22 执行脚本makeRef.sh cd reference sh makeRef.sh 执行者STAR e RSEM 执行脚本run.star.rsem.sh sh run.star.rsem.sh
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rnaseq-chr22-main.zip (26个子文件)
rnaseq-chr22-main
run.star.rsem.sh 2KB
input
B03_2.fq.gz 2.34MB
B01_2.fq.gz 2.35MB
B02_2.fq.gz 2.34MB
A03_2.fq.gz 2.36MB
tmp 1B
A01_2.fq.gz 2.37MB
A01_1.fq.gz 2.37MB
A03_1.fq.gz 2.36MB
B02_1.fq.gz 2.34MB
A02_1.fq.gz 2.36MB
B03_1.fq.gz 2.34MB
A02_2.fq.gz 2.36MB
B01_1.fq.gz 2.35MB
run.merge.files.R 2KB
run.down.apps.sh 219B
Dockerfile 552B
reference
makeRef.sh 518B
chr22.GRCh37.75.gtf.gz 789KB
tmp 1B
chr22.fa.gz 10.04MB
Transcript2Symbol.txt 1.54MB
run.make.samples.sh 1KB
README.md 472B
.gitpod.Dockerfile 568B
.gitpod.yml 165B
共 26 条
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