Intro-to-rnaseq-hpc-salmon

此REPO已存档，请访问当前课程。 使用高性能计算（HPC）的RNA-seq简介 观众 所需的计算能力 期间 生物学家 没有任何 2天的研讨会（约13个小时，由讲师指导） 描述 该资料库提供了为期2天的RNA测序数据分析研讨会的教学材料。 该研讨会的重点是教授基本的计算技能，以有效利用高性能计算环境来实现RNA-seq数据分析工作流程。 它包括对shell（bash）和shell脚本的介绍。 除了运行来自FASTQ文件的RNA-seq工作流程以使用Salmon进行数据计数外，该研讨会还涵盖了RNA-seq实验设计和数据组织/管理的最佳实践准则。 这些材料是为培训师主导的讲习班开发的，但也适合进行自学学习。 学习目标 了解用于分析高通量测序数据的命令行界面（bash）和HPC的必要性和用途。 了解设计RNA-seq实验并分析所得数据的最佳实践。 经验教训 以获取课程和建议时间表的链接。