scIdx:使用Alevin创建诱饵识别索引以进行scRNA-seq定量

单细胞 此回购包含了一些代码来构建与scRNA-SEQ数据的量化诱饵感知指数。 conda正在安装软件，有关确切的软件版本，请参见。 创建一个Alevin指数 基于Gencode注释（vM25，小鼠），使用整个基因组作为诱饵，与Alevin进行选择性比对，创建一个包含剪接和未剪接计数的索引。 我们可能永远不会需要速度，但是如果需要的话，那么使用此索引就可以轻松获得它。 为此，创建一个单独的conda环境。 #/ Create the envir: conda create --name alevin_idx #/ Save the software with the respective versions (#software-versions-used) as a plain text file alevin_idx_software.txt and then run: conda in