tree_move_examples

用于在树移动示例上测试UShER。 运行python makeTreeMoveTestExamples.py <example> <number>来产生一组2个与给定示例相对应的fasta文件，其中一个文件的所有样本都位于初始树中，一个文件中的所有样本都将添加。 示例文件应遵循以下格式： 面积S1 m1，m2，m3 S2平方米S3 m1，m3，m4，m5 S4 m1，m2，m3，m5，m6 S5 m1，m3，m5，m6 S6 m1，m5，m6 S7 m5，m6 S8 m6 等，以？结尾的突变转换为代表参考或替代的IUPAC。 我一直遵循此协议： 首先，像上面的一样创建一个example.txt文件。 然后： python makeTreeMoveTestExamples.py EXAMPLES/example1.