methylXprs:在多变量背景下将DNA甲基化与基因表达相关联的方法。 可以类似地评估任何可能的二分修饰语在这种关系中的作用

甲基Xprs DNA甲基化已被证明是基因表达的重要调节剂。 这种关系是复杂的，一个区域中有多个CpG位点会影响表达，而不是孤立地由单个CpG位点影响。 'methylXprs'程序包提供了一种构建这些多CpG模型的方法，从而使甲基化与基因表达之间关系的上下文相关修饰符进一步复杂化。 特别是，开发了EPIExPRS，以通过包含CpG-by-race交互作用术语来量化和解释种族的上下文相关影响。 即，为了构建原始模型，使用TCGAbiolinks软件包从The Cancer Genome Atlas TCGA下载了成对的DNA甲基化和基因表达，以评估种族在DNA甲基化与基因表达之间的多变量关系中作为修饰子的作用。 下载了八种具有高非裔美国人代表性的肿瘤类型，使我们能够评估这些潜在差异。 因此，尽管随后的描述着重于种族（非裔美国人和欧洲裔美国人）所评估的背景，但可以评估任何潜在的二分修饰语（例