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derfinder:DER Finder的R包,一种RNA-seq数据差异表达分析方法
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2021-06-20
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DER Finder 测试版 这是 DER Finder 的 R 包的测试版,这是一种使用 RNA-seq 数据分析差异表达的方法。 DER Finder 一文中有详细描述。 论文中使用的分析代码在analysis_code.R 。 此存储库中的包是 DER Finder 手稿中描述的方法的精确实现。 该软件的最终版本明显比这个版本更高效,并且。 对于研究项目,请使用 Bioconductor 包而不是此存储库中的包,该包主要是出于历史/再现性原因而存在的。 官方包由 Leonardo Collado Torres 编写和维护,问题可以提交。 安装 您可以使用devtools包中的install_github函数直接从 GitHub 安装此包: library (devtools) install_github ('derfinder', 'alyssafrazee') 您可能还需
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derfinder:DER Finder的R包,一种RNA-seq数据差异表达分析方法 (103个子文件)
orbFrontalF53_Y.bam 8.1MB
orbFrontalF3_Y.bam 7.84MB
orbFrontalF11_Y.bam 6.76MB
orbFrontalF1_Y.bam 6.39MB
orbFrontalF32_Y.bam 5.96MB
orbFrontalF58_Y.bam 5.96MB
orbFrontalF47_Y.bam 4.91MB
orbFrontalF43_Y.bam 3.79MB
orbFrontalF42_Y.bam 3.59MB
orbFrontalF56_Y.bam 1.91MB
orbFrontalF2_Y.bam 1.71MB
orbFrontalF55_Y.bam 1.4MB
orbFrontalF33_Y.bam 1.4MB
orbFrontalF23_Y.bam 1.18MB
orbFrontalF40_Y.bam 878KB
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get.pvals.DF.R 5KB
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find.mean.down.Rd 2KB
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find.sd.Rd 1KB
getColmeds.Rd 1KB
sqldf.Rd 1KB
getParams.failsafe.Rd 1KB
getExons.Rd 1KB
getFlags.Rd 1KB
makeDb.Rd 1KB
getTstats.Rd 1KB
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derfinder-package.Rd 974B
match.funfn.Rd 926B
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findclosest.ahead.Rd 557B
findclosest.behind.Rd 556B
last.Rd 406B
tx.sex.cuff-UPDATED.rda 14.37MB
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SouravGoswami
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