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RAREVATOR:用于检测稀有参考等位基因位点变异的工具-开源
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RAREVATOR(RAre REference Variant annotaTOR)是一种用于从第二代测序数据中识别和注释稀有参考等位基因位点中的种系和体细胞变异的工具。 RAREVATOR 已在 BMC Genomics 上发表。 Magi A、D'Aurizio R、Palombo F、Cifola I、Tattini L、Semeraro R、Pippucci T、Giusti B、Romeo G、Abbate R、Gensini GF。 人类基因组中隐藏的稀有变异的表征和鉴定。 BMC基因组学。 2015 年 4 月 24 日;16:340。 doi:10.1186/s12864-015-1481-9。
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RAREVATOR_package.tar.gz (58个子文件)
RAREVATOR
ProvaListSomatic.txt 75B
Lib
._RAREVATORGermline.R 222B
._RAREVATORPrepare.R 222B
RAREVATORGermline.R 2KB
RAREVATORSomatic.R 6KB
RAREVATORPrepare.R 902B
._RAREVATORSomatic.R 222B
._ProvaListGermline.txt 222B
._Data4Annotate 222B
._ProvaListSomatic.txt 222B
ProvaListGermline.txt 76B
.DS_Store 6KB
RAREVATOR.pl 6KB
._.DS_Store 82B
._README.txt 171B
Data4Call
RRVs4Call_SNV_1KG.bed 1.7MB
RRVs4Call_SNV_HG19.vcf 3.22MB
RRVs4Call_SNV_HG19.bed 1.94MB
RRVs4Call_INDEL_HG38.bed 87KB
RRVs4Call_INDEL_HG38.vcf 153KB
RRVs4Call_INDEL_HG19.vcf.idx 29KB
RRVs4Call_SNV_HG19.vcf.idx 132KB
._RRVs4Call_INDEL_HG19.vcf 222B
._RRVs4Call_INDEL_HG38.bed 222B
._RRVs4Call_SNV_1KG.vcf 222B
._RRVs4Call_SNV_HG19.bed 222B
RRVs4Call_SNV_HG38.bed 1.76MB
._RRVs4Call_INDEL_1KG.vcf 222B
RRVs4Call_INDEL_HG19.vcf 457KB
._RRVs4Call_INDEL_HG38.vcf 222B
._RRVs4Call_SNV_1KG.bed 222B
RRVs4Call_SNV_1KG.vcf 2.97MB
RRVs4Call_INDEL_HG19.bed 261KB
RRVs4Call_SNV_HG38.vcf 2.92MB
._RRVs4Call_SNV_HG38.vcf 222B
._RRVs4Call_INDEL_HG19.bed 222B
._RRVs4Call_SNV_HG38.bed 222B
RRVs4Call_INDEL_1KG.bed 229KB
RRVs4Call_INDEL_1KG.vcf 424KB
._RRVs4Call_INDEL_1KG.bed 222B
._RRVs4Call_SNV_HG19.vcf 222B
._RRVs4Call_INDEL_HG19.vcf.idx 222B
._RRVs4Call_SNV_HG19.vcf.idx 222B
Data4Annotate
._Header.txt 222B
RRAsAnnotation_INDEL_HG19.txt 6.76MB
RRAsAnnotation_SNV_HG19.txt 41.01MB
._RRAsAnnotation_INDEL_HG38.txt 222B
RRAsAnnotation_SNV_HG38.txt 36.84MB
RRAsAnnotation_INDEL_HG38.txt 2.36MB
._RRAsAnnotation_SNV_HG38.txt 222B
._RRAsAnnotation_SNV_HG19.txt 222B
Header.txt 435B
._RRAsAnnotation_INDEL_HG19.txt 222B
README.txt 2KB
._RAREVATOR.pl 273B
._Lib 222B
._Data4Call 222B
._RAREVATOR 222B
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锦宣
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