matlabdfe代码-asexual-lineage-adaptation:用于模拟和推断DFE（适应度效应分布）的Matla...

matlab dfe代码无性血统适应 用于模拟和推断 DFE（适应度效应分布）的 Matlab 代码，参见“实验室出芽酵母种群中突变谱系的命运和有益突变的适应度效应分布”EM Frenkel、BH Good、MM Desai。 遗传学, 2014 () 首先，将目录“custom Matlab functs”和“simulation code”添加到路径中，然后打开“scripts to test code”目录中的“script_showMeSomeTrajs.m”文件。 那里以及文件 simTraj.m 和 returnGenMutFunct.m 中的注释应该解释如何运行模拟并绘制其结果。 请注意，测试脚本被分成多个部分，其边界由双 %% 定义（请参阅 参考资料），并且一次只运行单个部分。 DFE 推理是通过在计算集群上并行执行许多数据模拟并迭代分析结果以确定哪些参数值需要进一步模拟来完成的。 这方面工作的代码不是非常可移植的状态，因此没有包含在存储库中。 同样，需要清理自适应速率建模的代码（图 6）以进行分发。 如果有人想使用它们，我很乐意这样做，所以请随时与我联系。 -叶夫根尼