没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
吉布斯采样matlab代码-CDSeq:CDSeqMATLAB代码。CDSeq是一种用于解剖组织异质性的新型计算完全去卷积方法
共83个文件
m:37个
cpp:8个
sh:8个
需积分: 15 0 下载量 89 浏览量
2021-05-28
05:57:24
上传
评论
收藏 665KB ZIP 举报
温馨提示
吉布斯采样matlab代码CDSeq:用于解剖组织异质性的完整反卷积方法 CDSeq能够使用大量RNA-seq数据同时估算细胞类型特异性基因表达谱和样品特异性细胞类型比例。 CDSeq R软件包: 我们现在有了一个R包,并实现了一些新功能 CDSeq MATLAB代码版本0.1.1 免费供学术和教育使用。 请与我联系以用于商业用途。 这是用于计算反卷积方法CDSeq的MATLAB代码。 参考:使用RNA-seq数据的新型计算完全解卷积方法(已提交)作者:Kai Kai,Qian Meng,Igor Shats,David Umbach,Melissa Li,Li Yuanyuan Li,Li Xiaoling,Leleping Li。 单位:国家环境卫生科学研究所,生物统计学和计算生物学分会和信号转导实验室。 CDSeq MATLAB代码版本0.1.2 添加了数据稀释选项以加快算法的速度。 我们在您可以在bioRxiv上找到的手稿中提供了解释。 有关详细信息,请查看CDSeq_012中的demo.m。 CDSeq MATLAB代码版本0.1.4 更新: 我对大型向量使用了无符号的短整数
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
CDSeq-master.zip (83个子文件)
CDSeq-master
CDSeq_012
cokus.cpp 7KB
Fastq_process.sh 4KB
Mat2Vec.m 894B
CDSeqGibbsSampler.mexa64 13KB
README.md 150B
Combine_fastq.sh 1KB
CDSeq.m 12KB
CDSeqGibbsSampler.mexw64 20KB
Demo.m 8KB
ctrlcDetect.h 5KB
gene2rpkm.m 1KB
CDSeqGibbsSampler.m 508B
SyntheticMixtureData.mat 126KB
CDSeqGibbsSampler.mexmaci64 13KB
README.txt 4KB
logpost.m 389B
CDSeqGibbsSampler.cpp 7KB
munkres.m 6KB
read2gene.m 476B
RNA2Cell.m 831B
README.md 2KB
CDSeq_011
cokus.cpp 7KB
Fastq_process.sh 4KB
Mat2Vec.m 894B
CDSeqGibbsSampler.mexa64 13KB
Combine_fastq.sh 1KB
CDSeq.m 11KB
CDSeqGibbsSampler.mexw64 20KB
Demo.m 7KB
ctrlcDetect.h 5KB
gene2rpkm.m 1KB
CDSeqGibbsSampler.m 508B
SyntheticMixtureData.mat 108KB
CDSeqGibbsSampler.mexmaci64 13KB
README.txt 4KB
logpost.m 389B
CDSeqGibbsSampler.cpp 7KB
munkres.m 6KB
read2gene.m 476B
RNA2Cell.m 831B
LICENSE 34KB
CDSeq_012_Octave
cokus.cpp 7KB
CDSeqGibbsSampler.mex 13KB
Fastq_process.sh 4KB
Mat2Vec.m 894B
CDSeqGibbsSampler.mexa64 13KB
README.md 734B
Combine_fastq.sh 1KB
CDSeq.m 11KB
CDSeqGibbsSampler.mexw64 20KB
Demo.m 8KB
CDSeqGibbsSampler.o 8KB
ctrlcDetect.h 5KB
gene2rpkm.m 1KB
CDSeqGibbsSampler.m 508B
SyntheticMixtureData.mat 126KB
CDSeqGibbsSampler.mexmaci64 13KB
README.txt 4KB
logpost.m 389B
CDSeqGibbsSampler.cpp 7KB
munkres.m 6KB
read2gene.m 476B
RNA2Cell.m 831B
CDSeq_SyntheticMixtureCellLine
cell_line_data_info.md 752B
CSHL_cellline_data_process.m 4KB
CDSeq_014
cokus.cpp 7KB
Fastq_process.sh 4KB
Mat2Vec.m 1KB
CDSeqGibbsSampler.mexa64 13KB
Combine_fastq.sh 1KB
CDSeq.m 12KB
Demo.m 10KB
ctrlcDetect.h 5KB
gene2rpkm.m 1KB
CDSeqGibbsSampler.m 508B
SyntheticMixtureData.mat 126KB
CDSeqGibbsSampler.mexmaci64 17KB
README.txt 4KB
logpost.m 389B
CDSeqGibbsSampler.cpp 9KB
munkres.m 6KB
read2gene.m 476B
RNA2Cell.m 831B
共 83 条
- 1
资源评论
weixin_38734361
- 粉丝: 6
- 资源: 904
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功