利用植原体16S rDNA通用引物对水稻橙叶病发病植株的DNA进行了PCR扩增和基因克隆。序列测定表明，PCR扩增的片段全长为1 853 bp，包括1 527 bp的水稻橙叶病植原体（RYL）的16S rDNA基因全序列、234 bp的邻近间隔区的序列及部分（92 bp）23S rDNA基因序列。序列比较结果表明，RYL的16S rDNA全序列与其他植原体的相似性在88%～95%，其中与America aster yellows（AAY，GenBank登录号X68373）最高相似性为95%。利用最大简约法
