matlab的egde源代码-AMICI:先进的CVODES和IDAS多语言界面

matlab的egde源代码 用于CVODES和IDAS的高级多语言界面 关于 AMICI为求解器（对于常微分方程）和（对于代数微分方程）提供了多语言（Python，C ++，Matlab）接口。 AMICI允许用户读取指定为或的微分方程模型，并将这些模型自动编译为Python模块，C ++库或Matlab .mex仿真文件。 与（不再维护的）Matlab接口相反，所有必需的功能都被转换为本地C ++代码，从而大大加快了仿真速度。 除了前向集成之外，编译后的仿真文件还允许对基于似然的输出函数进行前向灵敏度分析，稳态灵敏度分析和伴随灵敏度分析。 该界面旨在为生化React模型参数估计中的有效梯度计算提供例程，但它也适用于范围更广的微分方程约束的优化问题。 当前构建状态 特征 SBML导入 PySB导入 生成用于模型仿真和灵敏度计算的C ++代码 访问和高度可定制的CVODES和IDAS求解器 Python，C ++，Matlab接口 敏感性分析 向前 稳定状态 伴随的 一阶和二阶 预平衡和预模拟条件 支持（仅适用于Matlab） 界面和工作流程 AMICI工作流程始于从模型（Matlab