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dmcmatlab代码-GMLM_dmc:用于神经群体尖峰训练降维的广义多线性模型。用于决策任务,但可以更广泛地使用
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2021-06-16
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dmc matlab代码GMLM_dmc 用于神经群体尖峰训练降维的广义多线性模型。 虽然此代码旨在为决策任务期间的响应建模,但可以更广泛地使用。 目前,该代码仅支持泊松尖峰计数观察 - 但这可以扩展。 主要的 GMLM 类可以处理同时或独立记录的神经元。 未来的更新将包括专门针对人口记录优化的 GMLM。 代码的核心是一个具有优化对数似然和导数计算的 C++/CUDA 库。 此代码需要支持 CUDA 的 GPU。 包括用于执行 HMC 的代码。 目前,只提供了一个 MATLAB 接口,但我可能会尝试添加一个 Python 接口。 虽然我可以让模型在 PyTorch 或 Tensorflow 中工作,但像 HMC 一样运行推理需要我可以获得的所有性能。 这就是它在 CUDA 中的原因。 给出了执行延迟匹配到类别 (DMC) 任务的猕猴的示例数据集和代码。
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