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matlabami代码-DSINMF:DSINMF
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2021-06-07
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matlab ami代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序检测细胞类型 概述: 这是在论文“实验”部分给出的基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序中检测细胞类型的代码。这里的编码是论文中给出的算法的概括。 DSINMF 是用 MATLAB 编程语言编写的。 要使用,请下载 DSINMF 文件夹并按照 README.doc 中提供的说明进行操作。 文件: run_DSINMF.m - 主要功能。 factorization_AB.m - 降维 factorization_BF.m - 深度矩阵分解 constructW.m - 计算相邻矩阵 W。 NormalizeUV.m - 标准化数据。 bestMap.m - 置换 L2 的标签以尽可能匹配 L1。 compute_NMI.m - 用于计算两个聚类之间的归一化互信息 (NMI) 的程序。 AMI.m - 用于计算两个集群之间调整后的互信息 (AMI) 的程序。 ARI.m - 用于计算两个聚类之间的调整后的兰德指数 (Hubert & Arabie) 的程序。 Hungarian.m - 使用匈牙利方法解决分
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DSINMF-main.zip (16个子文件)
DSINMF-main
hungarian.m 11KB
SK_normalize.m 334B
bestMap.m 710B
excute_run_DSINMF.m 691B
ARI.m 1KB
AMI.m 4KB
run_DSINMF.m 2KB
softx.m 311B
compute_NMI.m 803B
NormalizeUV.m 847B
README.md 2KB
README.doc 20KB
function_ds.m 142B
constructW.m 19KB
factorization_BF.m 3KB
factorization_AB.m 3KB
共 16 条
- 1
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