matlabami代码-RA3_source:“单细胞表观遗传学表征的参考指导方法”中结果再现的源代码

matlab ami代码RA3的源代码 “单细胞表观遗传特征的参考指导方法”中的结果复制源代码。 我们还提供了一个为社区提供便利。 要求 用于 RA3 模型的 Matlab R2019a 用于细胞聚类的 Python 3.6.10 R 3.6.1 用于数据可视化和下游分析 使用说明 代码 功能 RA3_func.m RA3模型的主要功能 RA3_script.m RA3的数据预处理和模型初始化 run_RA3_script.m RA3 运行脚本 plot_case_fig1.R 图1bcef plot_residual.R 图1d plot_case.R 图 2abc、补充图 1bcde 和补充图 2abdef plot_case_pbmc.R 图 2d 和补充图 2cg plot_fig3_scatter.R 图 3 run_clustering_RA3.py RA3的聚类 plot_fig3-2_AMI_bar.R 图 4a 和补充图 6a plot_fig4_AMI_line.R 图 4b 和补充图 6b plot_bar_ragi.R 图 4c trajectory.R 轨迹推