在生物信息学中,微阵列实验的目标之一可以是找到那些上调或/和下调的基因。 SAM 是 Tusher 等人(2001 年)建议的一种实现该目标的方法,并且在 R 编程语言中有两种实现。 由于 SAM 尚未在 Matlab 中实现,我们提供了基于 BioConductor 项目库 siggenes 的第一个实现,感谢 Holger Schwender (2012) 的许可。
要查看建议实现的扩展说明,请参阅演示文件“SAM_demo.m”。
参考。
Virginia Goss Tusher、Robert Tibshirani、Gilbert Chu (2001)。 应用于电离辐射响应的微阵列的意义分析。 美国国家科学院院刊 98(9):5116-5121。
霍尔格·施文德 (2012)。 siggenes :使用 SAM 和 Efron 的经验贝叶斯方法进行多重测试。 R 包版本 1