颅骨分割matlab代码头骨数据处理
Python
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Matlab脚本从CT扫描中分割人类头骨,清洁分割后的头骨,将头骨体积转换为网格并向健康头骨注入Kong洞。
Python
3.6
MATLAB
R2018b
MeshLab
v2016.12
ITK-SNAP
3.6.0
3D切片机4.8.1
r26813
网格混合器3.5.474
通过CT扫描分割颅骨
依赖:
。
安装:
pip
install
pynrrd
,
pip
install
-U
pydicom
用法
:
1.更改目录2.在命令窗口中运行:
python
segmentation.py
注意:该脚本可以读取直接从CT机导出的dicom文件进行分段,也可以读取使用3D
Slicer从dicom文件转换而来的nrrd文件。
您需要指定头骨分割的阈值,通常建议使用100--max
。
颅骨数据清理
依赖:
。
安装:
pip
install
connected-components-3d
用法
:
1.将data_dir和save_dir更改为存储原始nrrd文件的位置以及要将清理后的nrrd文件保存到的位置。
2.在命
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