matlabr2012b代码-heterozygous-indel-detection:Matlab脚本从样本序列中减去参考序列...

Matlab R2012b代码杂合插入缺失检测 Matlab脚本从样本序列中减去参考序列-用于检测杂合插入/缺失。 描述 对于基因组杂合部分的序列痕迹，某些位置将显示“混合峰”，其中两个核苷酸占优势，因为两个染色体在该位置的序列不同。 通过检查序列轨迹，手动检测这些位置非常容易。 但是，如果其中一条染色体包含一个插入/缺失（插入/缺失），这将具有挑战性，在这种情况下，插入/缺失位置之外的所有位置都会出现混合峰，这使得通过人工检查减去参考序列非常困难。 用法 要使用此功能，请先将序列文件从转换为.fcs。 如果当前使用的是.ab1，并且用户使用的是OS X，则可以使用以下说明（从此网站修改：；特别是Jan Van Haarst的帖子中的方法）： 打开终端 光盘到编 运行convert_trace命令； 例如：./convert_trace -out_format scf <salr> salr_EagI_PCR_rev-PAA-04.fcs 将输出文件从编目录移至所需目录 此函数没有任何输入或输出参数。 只需在下面的第一行中键入参考文件名和