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期权matlab代码-MRM-Ion_Pair_Finder:来自非目标代谢组学数据的已定义MRM转换
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2021-05-26
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预算matlab代码MRM离子对查找器 介绍 伪靶向代谢组学是一种基于UHPLC-TQMS进行高覆盖率代谢组学分析的新方法。 MRM离子对查找器软件是在我们实验室中独立开发和编写的程序,用于针对伪靶向代谢组学的MRM转换的大规模选择。 使用了Matlab(版本7.14.739,R2012a,64位)。 MRM-Ion Pair Finder v2.0在原始版本的基础上进行了改进,从而简化了程序并提高了运行效率。 使用Matlab语言(R2018b,64位)。 为了使更多的研究人员可以使用MRM离子对查找器,我们还提供了基于R的版本。 发展 MRM离子对查找器用于自动和系统地定义非靶向代谢组学数据中的MRM过渡。 我们的研究小组于2012年通过保留时间锁定GC-MS选择的离子监测首次引入了伪靶向代谢组学的概念。伪靶向代谢组学方法于2013年扩展到LC-MS。开发了软件“多React监测-离子对查找器(MRM-Ion Pair Finder)”,它使针对非目标代谢谱分析的MRM过渡的定义变得更加容易且耗时更少。 最近,MRM离子对查找器已更新至版本2.0。 新版本更方便,耗时更少,还适用于
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MRM-Ion_Pair_Finder-master.zip (24个子文件)
MRM-Ion_Pair_Finder-master
matlab
readandprocess_MS1MS2_togetRESU.m 13KB
tohelp.m 3KB
thechar.txt 137KB
NEW_FINDER.m 28KB
User Manual for MRM-Ion Pair Finder software v2.0.pdf 1.01MB
NEW_FINDER.fig 22KB
resu_read_pretreat_match_MS1.mat 129KB
tohelp.fig 7KB
thedata.txt 369KB
User Manual for MRM-Ion Pair Finder software v2.0.doc 587KB
R
Peak detection and annotation
xcms_CAMERA_Delete_redundant in negative mode.R 3KB
xcms_CAMERA_Delete_redundant in positive mode.R 3KB
Retention time calibration
Retention_time_calibration.R 2KB
Test data
Retention time of MRM transitions on UHPLC-HRMS.txt 64B
Retention calibration result.txt 105B
Retention time of internal standards on UHPLC-HRMS.txt 35B
Retention time of internal standards on UHPLC-TQMS.txt 34B
MRM-Ion Pair Finder
MRM_Ion_Pair_Finder.R 8KB
example for MRM_Ion_Pair_Finder.R 851B
README.md 4KB
Data
MS2
45V.mgf 8.16MB
30V.mgf 9.97MB
15V.mgf 10.26MB
MS1
Delete Iso-Add Result.csv 214KB
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