没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
律压缩扩张方法matlab代码-ebs:基于能量的分子机分段常数信号重构方案
共43个文件
h:15个
txt:5个
m:4个
需积分: 10 0 下载量 28 浏览量
2021-05-21
15:55:24
上传
评论
收藏 1.17MB ZIP 举报
温馨提示
律压缩扩张方法matlab代码基于能量的步检测(EBS) 该存储库包含论文“基于分子机制的分段常数信号的基于能量的重构方案”中描述的方法的实现。 介绍 分析单个基于DNA的分子机器(例如聚合酶和解旋酶)的物理和化学特性通常需要跟踪碱基对长度范围内的运动。 尽管已经开发出能够达到该极限的高分辨率仪器,但是单个步骤常常被大量的噪声隐藏起来,这使数据处理变得复杂。 EBS项目实施了一种有效的算法,该算法通过最小化能量功能来检测高带宽信号中的阶跃。 第一步,应用有效的凸降噪方案,该方案允许压缩幅度和平稳长度的小节。 因此,可以使用更复杂的方法来在向先验信息进行核算的同时向步骤数据分配步骤。 为此,我们采用了在图形上制定的组合优化算法。 用法 构建EBS之后,可执行文件将驻留在build/bin/ 。 您可以从那里打电话给他们。 下面的文档假定二进制文件在那里。 一般说明 EBS包含四个可执行文件: lambdaopt使用启发式方法确定最佳TVDN正则化参数 denoising通过求解TVDN问题来消除噪声 level_generator生成一个文件,其中包含要在其上集群的一组级别 graph_
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
ebs-master.zip (43个子文件)
ebs-master
.gitignore 285B
matlab
simulation
mm
mminfo.m 3KB
mmwrite.m 7KB
mmread.m 7KB
demo.m 3KB
.travis.yml 764B
LICENSE 11KB
.gitmodules 113B
libs
CMakeLists.txt 85B
README.md 10KB
python
pwcs_data.mm 1.78MB
time_data.mm 929KB
demo.py 2KB
noisy_data.mm 1.81MB
cmake
standard_flags.cmake 469B
add_boost.cmake 10KB
utils.cmake 11KB
appveyor.yml 219B
graph_processing
cmd_helpers.h 706B
runtime_statistics.h 1KB
sitesstore.h 8KB
graph_processing_main.cpp 11KB
energy.h 20KB
helpers.h 6KB
binopt.h 23KB
bk_max_flow.h 36KB
level_generator_main.cpp 5KB
counting_statistics.h 18KB
CMakeLists.txt 2KB
denoising
lambda_max.h 2KB
lambdaopt_main.cpp 3KB
denoising_main.cpp 4KB
condat_denoise.h 3KB
helpers.h 115B
lambda_opt.h 5KB
CMakeLists.txt 2KB
common
cmd_helpers.h 8KB
tuple_helper.h 3KB
helpers.h 6KB
CMakeLists.txt 68B
demo_plot_outtake.png 65KB
CMakeLists.txt 835B
demo_plot_full.png 50KB
共 43 条
- 1
资源评论
weixin_38601446
- 粉丝: 7
- 资源: 939
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功