层次分析matlab代码-e2198-gc-analysis:发布e2198中追踪的神经节细胞的连接组学分析

层次分析matlab代码e2198-gc-分析 e2198中追踪的神经节细胞的连接组学分析。 请注意，此存储库中包含两个子模块。 它们构成了后续分析中使用的代码库。 要从子模块下载所有相关的数据和代码，请使用git命令git submodule update --init 。 在适当的情况下，特定子文件夹中的其他文档也可以作为README.md文件获得。 EM数据，细胞重建/ e2198_reconstruction 该子模块包含许多初始步骤，以及几乎所有后续分析所需的更常规的工具。 特别是在这里可以使用创建初始cell_info结构的代码。 （有关其他详细信息，请参见子模块中的自述文件） 重要的是，由于分层聚类而产生的最终单元格类型分配位于此存储库中包含的cell_info_typedef_gc.m文件中。 在此子模块中具有特殊兴趣的例程包括： EM卷的计算平坦化和下采样 钙成像数据和分析/ e2198_Ca_imaging 原始钙成像数据以及与该数据有关的所有分析均在此子模块中。 此文件夹中还包含一些较早的层次结构群集工作。 在此子模块中记录了EM数据方向，视觉刺激方向和最终极坐标