植物内生细菌XG32菌株16S rRNA寡核普酸探针杂交条件优化和特异性验证 (2011年)

为了能利用荧光原位杂交方法来研究植物内生细菌XG32菌株在植物体内的定殖和分布,利用XG32 菌株的16S rRNA中段特异性序列和Genbank数据库,用BLAST、DNAclub和Oligo软件设计了一个在理论上具有特异性的探针,在优化该探针的杂交条件基础上,通过与12个亲缘关系相邻和相近的菌株反复杂交来验证探针的特异性.结果显示,XG32探针适宜的杂交条件为:杂交缓冲液中甲酰胺浓度为35%,NaCl浓度为1.2 mol/ L,杂交温度为42℃,清洗缓冲液中NaCl浓度为0.02 mol/L;探针与X