没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
16s捕获:Pipleine代码,“通过广泛的16S rRNA富集来敏感鉴定临床标本中的细菌DNA”
共29个文件
py:9个
conf:5个
tgz:2个
需积分: 10 0 下载量 57 浏览量
2021-02-14
02:51:23
上传
评论
收藏 1.01MB ZIP 举报
温馨提示
16S rRNA捕获管线 Pipleine代码,“通过广泛的16S rRNA富集来敏感鉴定临床标本中的细菌DNA” Sara Rassoulian Barrett [1],Noah G. Hoffman [1],Christopher Rosenthal [1],Andrew Bryan [1],Desiree A. Marshall [2],Joshua Lieberman [1],Brad T. Cookson [1],Stephen J. Salipante [1](通讯作者) [1]美国华盛顿州华盛顿大学华盛顿大学检验医学系 [2]美国华盛顿特区华盛顿大学病理学系 设置 创建一个virtualenv: python3 -m venv py3-env source py3-env/bin/activate pip install -U pip wheel pip install
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
16s-capture-master.zip (29个子文件)
16s-capture-master
singularity
Singularity_htstream 425B
Singularity_epa 471B
Singularity_ea-utils 448B
Singularity_krona 492B
Singularity_gappa 407B
data-sra.conf 14KB
README.rst 3KB
data-sara.conf 6KB
bin
get_classifications.py 6KB
check_data.py 1KB
read_depth.py 1KB
get_consensus.py 2KB
read_stats.py 2KB
cmfilter.py 3KB
get_model_descriptor.py 1KB
merge.py 2KB
histogram.py 1KB
data
Illumina_adaptors_v2.fa 466B
RRNA_16S_BACTERIA.calibrated.cm 924KB
sra.csv 7KB
krona_labels.csv 3KB
SConstruct 13KB
data.conf 17KB
data-small.conf 909B
src
pear-0.9.11-linux-x86_64.tgz 706KB
pear-src-0.9.11.tgz 166KB
settings.conf 1KB
requirements.txt 65B
.gitignore 64B
共 29 条
- 1
资源评论
Dr熊吉
- 粉丝: 30
- 资源: 4603
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功