POSCARtoolkit功能_v21
需积分: 0 4 浏览量
2022-08-03
21:35:46
上传
评论
收藏 515KB PDF 举报
POSCARtoolkit.py
在学习下面 neb 的计算前，思考了很久，感觉有必要先给
大家介绍一个非常实用的 python 小脚本，经历过反复的修
改，最终在 TAMAS 的努力下，完成了一个稳定的版本，
本节我们介绍一下这个脚本的具体使用方法。
1 这个脚本有 2 个版本，分别适用于 python3 和 python2 的 2.6 及以上版本，大家根据自己
使用的 python 版本进行下载，如果运行的时候出现错误，请先检查是不是版本的问题。
2 使用前的准备工作：
2.1）下载脚本，将脚本命名为：POSCARtoolkit.py
2.2）可执行化：chmod u+x POSCARtoolkit.py
2.3）将脚本移到~/bin 文件夹下面： mv POSCARtoolkit.py ~/bin
注释：
2.2 和 2.3 步的顺序可以颠倒，不影响使用
如果没有~/bin 文件夹，那么 mkdir ~/bin 手动创建一个即可。
3 实现分数坐标（Direct）向笛卡尔坐标（Cartesian）的转换：
VASP 的输出结果是以分数坐标的形式存在 CONTCAR 中，但我们在操作模型的过程中，移
动原子都是以 Å 来进行的，所以讲分数坐标转化为笛卡尔坐标对于搭建模型很有帮助。
脚本用法： POSCARtoolkit.py -i POSCAR
注意：如果你的 POSCARtoolkit.py 脚本在和 POSCAR 一个目录下，使用下图中的命令，如
果你已经完成了前面 2 中的步骤，脚本前面的 python 不用输入。
设计师马丁
- 粉丝: 18
- 资源: 299
最新资源
- Git教程：git相关基础概念教程，简单易懂
- 循环小组作业.cpp
- 1716305449283252_order-blog
- cc test for cc
- 蚁群算法基于matlab实现，有源代码，和详细的说明文件，matlab仿真的数据及参数输入的值都一给定好
- 20231201HlBwnVr1.zip
- 基于py+matlab MATLAB实时数字图像相关软件用于监测在康奈尔高能同步加速器上进行的原位机械加载高能x射线衍射
- 基于matlab实现字符识别的参考程序，用所用的字体识别率挺高，部分手写的也能识别，但是还不能识别扭曲和倾斜的字符 .rar
- 基于matlab实现指纹识别系统 包括数据库导入、图像选择识别、帮助功能、识别图像可视、gabor滤波可视，实现界面操作.rar
- 基于matlab实现指纹识别，利用gabor滤波器，提取指纹特征，只能呢读取bmp图像.rar
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议，欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理！
点击此处反馈
评论0