一个非常全的人类基因id转换工具.pdf
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2020-02-24
23:23:07
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一个非常全的人类基因id转换工具
2020年2月20日我在github和CRAN上对它进行了更新，支持转换的id种类更多！同时它对基因id的转
换率也很不错。
小提示：在家里我发现用电脑从github上安装R包会很慢，但是用电脑连接手机热点却可以比较轻松的
安装github上的R包。
GeoTcgaData的安装方法为：
从github上安装开发中的版本：
如果电脑上没有安装devtools，也可以使用remotes来安装github上的包。remotes包比devtools小的
多，也更好安装。
或者从CRAN上安装稳定版
它所支持的id种类为：
GeoTcgaData包中有一个id转换的函数：`id_conversion_vector()` , 它可以对人类的各种
基因id进行转换。2019年9月第一次发布，目前这个包在CRAN的下载量为1633次：
> dlstats::cran_stats("GeoTcgaData")
start end downloads package
1 2019-09-01 2019-09-30 412 GeoTcgaData
2 2019-10-01 2019-10-31 168 GeoTcgaData
3 2019-11-01 2019-11-30 204 GeoTcgaData
4 2019-12-01 2019-12-31 206 GeoTcgaData
5 2020-01-01 2020-01-31 441 GeoTcgaData
6 2020-02-01 2020-02-24 202 GeoTcgaData
> sum(dlstats::cran_stats("GeoTcgaData")$downloads)
[1] 1633
if(!requireNamespace("devtools", quietly = TRUE))
install.packages("devtools")
devtools::install_github("huerqiang/GeoTcgaData")
if(!requireNamespace("remotes", quietly = TRUE))
install.packages("remotes")
remotes::install_github("huerqiang/GeoTcgaData")
install.packages("GeoTcgaData")
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