# HMM-FRET
Custom MATLAB code for Hidden Markov Analysis of single molecule FRET data.
The program **intensity_FRET_HMM** is the main execution code. The functions **kmean, HMM and statetransitions** are custom functions serve the main program intensity_FRET_HMM. The data format needs to be in **txt** format containing three columns of data, frames, donor intensity and acceptor intensity (reference example). The MATLAB code is still being improved. If you have any questions about using the program, please contact yangchenguang@iphy.ac.cn.
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用于单分子FRET数据的隐马尔可夫分析的MATLAB代码.zip
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2024-02-21
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1.版本:matlab2014/2019a/2021a 2.附赠案例数据可直接运行matlab程序。 3.代码特点:参数化编程、参数可方便更改、代码编程思路清晰、注释明细。 4.适用对象:计算机,电子信息工程、数学等专业的大学生课程设计、期末大作业和毕业设计。
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用于单分子FRET数据的隐马尔可夫分析的MATLAB代码.zip (6个子文件)
用于单分子FRET数据的隐马尔可夫分析的MATLAB代码
HMM-FRET-main
Example.txt 21KB
HMM.m 3KB
kmean.m 951B
statetransitions.m 452B
README.md 547B
intensity_fret_HMM.m 2KB
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