FRETSCAL:用于对用 YFP 和 CFP 标记的酵母细胞图像进行 FRET 分析。-matlab开发

FRETSCAL 筛选含有 CFP 和 YFP 标记蛋白的细胞图像，以确定两种荧光团之间的能量转移 (FRET) 程度。 FRETSCAL 的图形用户界面 (GUI) 允许用户指定用于识别图像中感兴趣区域 (AOI) 的标准。 标准包括信号背景比、信号强度与高斯分布的拟合、AOI 之间的最小距离、AOI 的大小、强度限制和周围背景区域的位置。 FRETSCAL 生成 AOI 的裁剪 TIFS，包括用户指定的围绕 AOI 的区域作为上下文。 用户可以筛选 AOI，根据目视检查和图像统计选择保留或丢弃 AOI。 最终输出是一个文本文件，其中包括强度数据和 FRET 指数 FretR 的计算。 FretR 可用作标记蛋白质之间距离的估计值。 FRETSCAL 附带用户手册和示例图像集。