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【资源】miRNA 数据库与靶基因分析软件
miRNA 数据库与靶基因分析软件
1.miRBase: .mirbase.org
miRBase 序列数据库是一个提供包括已发表的 miRNA 序
列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是
存储 miRNA 信息最主要的公共数据库之一。miRBase 提
供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线
搜索的 miRNA 和靶标信息。
2.miRecords: mirecords.biolead.org/
动物 mirna 的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验
证的, 预测的 miRNA 的靶目标. 靶标预测工具 DIANA-
microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2,
miTarget, NBmiRTar, PicTar, PITA, RNA22,
RNAhybrid, and TargetScan/TargertScanS.
3.PMRD: BioInformatics.cau.edu/PMRD/
PMRD 是一个关于植物 microRNA 数据库,包括了
microRNA 序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基
因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于植物
microRNA 的数据。
4.CoGeMiR: cogemir.tigem.it/
CoGeMiR 数据库总结关于在进化过程中 microRNA 在不
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