资源miRNA数据库及靶基因分析软件.doc
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2022-12-01
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【资源】miRNA 数据库与靶基因分析软件
miRNA 数据库与靶基因分析软件
1.miRBase: .mirbase.org
miRBase 序列数据库是一个提供包括已发表的 miRNA 序列
数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库，是存储
miRNA 信息最主要的公共数据库之一。miRBase 提供便捷的
网上查询服务，允许用户使用关键词或序列在线搜索的
miRNA 和靶标信息。
2.miRecords: mirecords.biolead.org/
动物 mirna 的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证
的, 预测的 miRNA 的靶目标. 靶标预测工具 DIANA-microT,
MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget, NBmiRTar,
PicTar, PITA, RNA22, RNAhybrid, and
TargetScan/TargertScanS.
3.PMRD: BioInformatics.cau.edu/PMRD/
PMRD 是一个关于植物 microRNA 数据库，包括了 microRNA
序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等，
并且该数据库尝试着整合大量的关于植物microRNA的数据。
4.CoGeMiR: cogemir.tigem.it/
CoGeMiR 数据库总结关于在进化过程中 microRNA 在不同动
物中的保守性。该数据库搜集的和预测的 microRNA 关于染
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