蛋白，配基_下载资源_代码源码-CSDN下载

从七肤噬菌体展示库中筛选蛋白质配基 (2004年) 为了研究噬菌体展示技术的应用,以溶菌酶为靶分子从七肤噬菌体展示库中筛选蛋白质的高亲和力噬菌体配体,所筛选的亲和力最高的噬菌体的ELISA检测值A405nm可达0.634.通过比较亲和性噬菌体外源插入肤的DNA序列,认为基元...

评级：0 浏览量：56 收藏量：0 资源大小：335KB 上传时间：2021-05-18

荧光光谱法研究中华蜜蜂化学感受蛋白与特异配基的相互作用 (2011年) 采用荧光光谱法研究了中华蜜蜂化学感受蛋白3( CSP3)与其特异性配基N-苯基-1-萘胺(N-phenyl-1-naphthylamine,1-NPN)的相互作用.结果表明,1-NPN能使CSP3在λem =328 nm处发生荧光猝灭,且猝灭机理为静态猝灭.另外,猝灭...

评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：314KB 上传时间：2021-05-15

分子对接软件 MVD分子对接，简单，方便。

评级：0 浏览量：1125 收藏量：1 资源大小：15.69MB 上传时间：2016-06-27

xPyder PyMOL Plugin:分析和可视化蛋白质中的偶联残基及其网络-开源 xPyder是一个PyMOL插件，用于分析和可视化3D结构动态互相关矩阵（DCCM），线性互信息（LMI），通信倾向（CP），分子内和分子间相互作用（例如PSN）等，生成高度可定制的出版物质量图像。 xPyder可以识别网络（使用集...

评级：0 浏览量：221 收藏量：0 资源大小：9.96MB 上传时间：2021-04-30

基于GSO算法的蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽和蛋白质-DNA对接框架_python_C++_代码_下载有很多可供用户进一步开发和优化的选项：它可以接受任何用户定义的评分函数，可以使用局部无梯度最小化，可以从一开始就限制模拟，专注于用户分配的相互作用区域，它支持受体和配体伙伴中的残基限制，并且支持使用...

评级：0 浏览量：161 收藏量：2 资源大小：114.29MB 上传时间：2022-06-07

基于LSTM和注意力机制预测蛋白质-配体结合亲和力.zip 基于LSTM和注意力机制预测蛋白质-配体结合亲和力蛋白质是生物体中普遍存在的一类重要生物大分子，由天然氨基酸通过肽键连接而成。它具有复杂的分子结构和特定的生物功能，是表达生物遗传性状的一类主要物质。 ...

评级：0 浏览量：7 收藏量：0 资源大小：13.06MB 上传时间：2024-05-20

benztropine类多巴胺转运蛋白配体的QSAR研究 (2001年) 利用Hansch方法,研究T 37种...所得到的benztropine类化合物diphenylmethoxy部位取代基的综合结构效应,对进一步研究该部位与多巴胺转运蛋白相互作用的电性和立体性质及设计新的多巴胺转运蛋白配体具有指导意义。

评级：0 浏览量：80 收藏量：0 资源大小：256KB 上传时间：2021-05-17

弹性网络模型揭示的大肠杆菌核糖结合蛋白的构象运动和残基波动分析核糖结合蛋白（RBP）是一种糖结合细菌周质蛋白，其功能与结合核糖后从开放构象到封闭构象的大变构构象变化有关。已发现开放式（无配体）和封闭式（配体结合）形式的RBP。在这里，我们通过使用两种粗粒度弹性网络...

评级：0 浏览量：140 收藏量：0 资源大小：1.46MB 上传时间：2021-04-03

人SEPT9蛋白同源建模和活性位点分析 (2014年) 利用生物信息学在线软件预测了人SETP9蛋白质的二级结构和模体信息,同时对其三级结构进行同源建模和模建结果质量评价,其次...搜寻获得了人SEPT9蛋白配基结合位点有10个,其中位点1可能是该蛋白的活性位点。这些研究结果

评级：0 浏览量：151 收藏量：0 资源大小：4.61MB 上传时间：2021-05-15

靶标替换消减SELEX技术筛选小鼠IgG Fc片段的DNA配基及其活性鉴定 (2011年) 建立高特异性和亲和力的小鼠IgG Fc片段DNA配基筛选方法。采用几种小鼠IgG亚类(鼠抗HBV-IgG,...特异性分析显示,此配基只与小鼠IgG特异性结合,与胰蛋白酶、小牛血清白蛋白、人血清均无明显结合。高压液相色谱和凝胶阻滞

评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：447KB 上传时间：2021-05-15

rmt:应用随机矩阵理论和pca鉴定HA蛋白中相关残基的簇基于随机矩阵理论的流感病毒HA蛋白中协同配位残基的鉴定参考客观的我们的目标是实施上述参考文献中有关流感-HA蛋白序列的方法。数据此存储库中的数据文件夹包含我们用来测试此脚本的数据集。

评级：0 浏览量：103 收藏量：0 资源大小：51KB 上传时间：2021-04-10

分子动力学模拟研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白与配体作用的影响 (2014年) 模拟结果表明, 108号残基突变前后, 电子等排体的两个氨基酸残基, 使蛋白与配体间的范德华相互作用发生明显变化, 同时导致蛋白的内部运动也发生变化, 进而影响蛋白与配体的相互作用. 进一步分析表明, 突变前后的蛋白...

评级：0 浏览量：181 收藏量：0 资源大小：3.92MB 上传时间：2021-05-09

lightdock:基于GSO算法的蛋白质-蛋白质，蛋白质-肽和蛋白质-DNA对接框架有许多选项可以由用户进一步开发和优化：它可以接受任何用户定义的评分功能，可以使用局部无梯度最小化，可以从一开始就限制仿真用户指定的相互作用区域，它支持受体和配体伙伴中的残基限制。 2.参考 LightDock协议...

评级：0 浏览量：272 收藏量：0 资源大小：32.58MB 上传时间：2021-05-09

组蛋白H4的原核表达及纯化亲和纯化是一种高效的蛋白质纯化技术，它利用蛋白质与特定配体之间的特异性相互作用来分离目标蛋白。例如，在这里，可能使用了含有镍离子（Ni2+）的亲和柱来纯化带有His标签的组蛋白H4突变体，因为His标签能够与镍...

评级：0 浏览量：142 收藏量：0 资源大小：551KB 上传时间：2020-02-01

complex_md_setup:本教程旨在说明使用 BioExcel Building Blocks 库 (biobb) 逐步说明建立包含蛋白质与配体... 使用的具体例子是T4 溶菌酶L99A/M102Q 蛋白（PDB 代码 3HTB），与2-丙基苯酚小分子（3 个字母的代码 JZ4）复合。设置使用的Biobb模块：从公共数据库中获取生物分子数据的工具。：用于模拟大分子结构的工具。 ...

评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：15.34MB 上传时间：2021-05-29

W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究* (2008年) 结晶水分子W301在几乎所有的HIV-1蛋白酶(HW-1 PR)和配体的晶体结构中出现．在HIV-1 PR中A链天门冬氨酸残基Asp25质子化状态或B链Asp25质子化状态下，QM/MM模拟后MM-GBSA方法计算得到W301水分子在HIV-1 PR/ABT-538结合...

评级：0 浏览量：96 收藏量：0 资源大小：204KB 上传时间：2021-06-01

大数据-算法-蛋白质修饰检测及定量新方法研究.pdf 电化学技术是研究的核心之一，特别是三电极系统，包括循环伏安法、差分脉冲伏安法和交流阻抗法等，这些方法被用来研究蛋白质的各种修饰，如蛋白酶切、磷酸化、糖基化等。电化学技术的优势在于能够直接和灵敏地检测...

评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：5.31MB 上传时间：2022-04-17

GuiTope:从肽选择中识别蛋白质中的重要区域。-开源通常比较感兴趣的是将所选的肽序列与天然蛋白结合伴侣进行比较，以推断出确切的结合位点或特定残基的重要性。 GuiTope提供了一种方便的方法，可将选定的肽序列与蛋白质序列进行比较，包括灵活的比对参数，新颖的...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：29KB 上传时间：2021-04-29

圆二色光谱在研究方案蛋白结构中的应用.doc 5. **药物设计和筛选**：CD光谱可用于评估小分子药物与靶标蛋白的相互作用，为药物设计提供结构基础。 6. **生物大分子相互作用研究**：CD可以揭示蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA/RNA等相互作用的结构特征，有助于理解...

评级：0 浏览量：33 收藏量：0 资源大小：35KB 上传时间：2021-10-11

光敏性卟啉金属配合物与牛血清白蛋白的结合及性能研究 (2010年) 结果表明,锌卟啉与牛血清白蛋白以配位键结合,当BSA与ZnTpHPP以较低比例(1∶1,1∶3)结合时,蛋白结构保持不变。在可见光照射下,考察了BSA-ZnTpHPP-1在BSA-ZnTpHPP-1/MV2+/TEOA光诱导电子转移体系中和甲基紫精(MV2

评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：1.28MB 上传时间：2021-05-29

MetaOdysseus：R包，用于基于质谱的富含半胱氨酸的金属结合蛋白的结构分析金属结合位点的鉴定和配位金属离子的Cys残基的定位。蛋白质结构和折叠分析。 MetaOdysseus地址：-电荷状态反卷积。 -统计评分。 -蛋白质复合物的质量分配。以下各节将举例说明在（doi :)中发布的一些示例在R中...

评级：0 浏览量：69 收藏量：0 资源大小：94KB 上传时间：2021-03-02

离子液体对木瓜蛋白酶催化特性的影响 (2012年) 研究了以1-丁基-3-甲基咪唑、四乙基铵及N-乙基吡啶为阳离子,配以多种阴离子(H2PO-4,ClO-4,HSO-4,CH3COO-,Cl-,Br-,NO-3,SCN-,BF-4,PF-6 )的离子液体对木瓜蛋白酶催化N-苯甲酰-L-精氨酸乙酯(BAEE)水解的活性及热稳定性...

评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：1.99MB 上传时间：2021-05-09

peat:PEAT是一套程序，用于捕获，分析和预测蛋白质的生物物理特征 PEATSA允许您分析每个氨基酸残基对蛋白质生物物理特性的影响。当前，对于一组给定的点突变，PEAT_SA计算pKa值，蛋白质稳定性和蛋白质-配体结合亲和力的变化。 DataPipeline是一个使用某些泥炭库进行数据处理的独立...

评级：0 浏览量：110 收藏量：0 资源大小：45.99MB 上传时间：2021-05-19

免疫球蛋白(IgG)吸附介质的合成及性能 (2008年) 以聚乙烯醇为载体,利用戊二醛为交联剂,得到交联球型聚乙烯醇,再通过环氧氯丙烷环氧化反应,偶联配基 L-色氨酸合成了一种新型免疫球蛋白( IgG)吸附剂。研究了色氨酸用量、pH值等参数对偶联量的影响。静态吸附试验结果...

评级：0 浏览量：44 收藏量：0 资源大小：1.77MB 上传时间：2021-05-26

染料亲和膜的制备及其吸附白蛋白的性能研究 (2008年) 以尼龙66膜为基膜，采用甲醛活化法偶联壳聚糖制备尼龙-壳聚糖复合膜，再固载染料Cibacron Blue F3GA作为配位基，制备亲和膜．膜上壳聚糖和Cibacron Blue F3GA的含量分别为112.4和123.3 mg/g尼龙膜．通过静态和动态...

评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：278KB 上传时间：2021-06-14

欺骗外表：“死亡”和“断裂”受体蛋白酪氨酸激酶的信号传导配体的结合导致受体单体的二聚化，然后是受体细胞质结构域内酪氨酸残基的转磷酸化。然而，这张整洁的照片在边缘潜伏着一些奇怪的人物。现在已经确定了 RTK 缺乏激酶活性的情况，但是，尽管已“死亡”，但似乎在...

评级：0 浏览量：43 收藏量：0 资源大小：144KB 上传时间：2021-06-29

大数据-算法-基于进化保守性及几何结构相似性的蛋白质与核酸相互作用位点的研究.pdf 7. **DNA结合蛋白数据库与结构比对**：为预测DNA结合位点，论文创建了一个包含224条蛋白质序列的数据库，并开发了新的结构比对算法，通过比较氨基酸-核酸亚基的几何结构相似性来预测结合位点。 8. **假阳性和假阴性...

评级：0 浏览量：40 收藏量：1 资源大小：5.22MB 上传时间：2022-04-17

DNA元基催化与肽计算_第5修订版本1 【DNA元基催化与肽计算】这一主题涉及的是生物信息学和计算化学的交叉领域，主要探讨DNA分子在催化反应中的作用以及与蛋白质（肽）计算的关联。在这个第五修订版的提案中，作者着重展示了德塔自然语言图灵系统的性能...

评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：8.43MB 上传时间：2022-08-08

Ⅱ型抗癌晶体蛋白的芳香族氨基酸及其与抗肝癌活性间的关系 (2012年) 结果表明:Ⅱ型抗癌晶体蛋白分子上位点49,51,52,55～60,194和205～212的氨基酸残基,特别是芳香族氨基酸在配体和受体蛋白质间的相互作用中起着重要作用;在Hex的蛋白质与蛋白质对接中,配体P11和P32与受体甘油醛-3-磷酸...

评级：0 浏览量：32 收藏量：0 资源大小：737KB 上传时间：2021-06-18

硫磺菌 LHJ1菌株培养基筛选 (2011年) 通过室内比较试验,对硫磺菌( ...研究表明,此菌株在供试的各种培养基上均可生长,但生长状况存在差异,其最佳母种培养基为配方⑥(蛋白胨葡萄糖综合培养基),较好的原种培养基为配方①、⑤(木屑、玉米粒培养基) 。

评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：1.37MB 上传时间：2021-05-30

刺桐胰蛋白酶抑制剂亲和层析填料的制备及应用 (2005年) 研究用交联琼脂糖为载体，三聚氯氰为活化剂，刺桐胰蛋白酶抑制剂为配基，制备亲和填料的方法。通过紫外和红外光谱分析，对制备的填料进行表征。用制备的亲和填料吸附重组人组织型纤溶酶原激活剂突变体（reteplase，r...

评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：3.27MB 上传时间：2021-05-25

纯化组氨酸标签蛋白金属鳌合亲和色谱填料的制备与性能 (2007年) 以琼脂糖(agarose)凝胶的珠状产品SepharoseCl-6B为基质,以环氧氯丙烷为活化剂,将天冬氯酸固定在琼脂糖凝胶微球上,在经与溴乙酸修饰后,最终得到含有羧甲基天冬氨酸结构的琼脂糖凝胶微球。以凝胶微球负载的多羧基为配...

评级：0 浏览量：68 收藏量：0 资源大小：362KB 上传时间：2021-05-17

半乳糖基化壳聚糖材料的合成与表征 (2007年) 半乳糖是肝细胞表面去唾液酸糖蛋白受体的特异性配体，是肝靶向基团，具有诱导和提高肝细胞在细胞外基质支架材料上的黏附性能。以壳聚糖为基体材料，在EDC和NHS的活化作用下，将半乳糖基引入到壳聚糖的结构中，合成和...

评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：783KB 上传时间：2021-04-25

镍离子亲和层析介质的制备及其用于组氨酸标记蛋白质的纯化 (2010年) 结果发现，在强碱条件下环氧活化率达到了38.0 umoL/mL，最终Ni2+配基密度达到了30.9 umoL/mL，偶联效率为81.3％。利用得到的镍离子亲和介质对基因工程大肠杆菌表达的组氨酸标记3-羟基丁酮还原酶进行了一步层析纯化，...

评级：0 浏览量：498 收藏量：0 资源大小：308KB 上传时间：2021-05-09

α-胰凝乳蛋白酶在相转移Fe3O4纳米粒子表面的固定化 (2010年) 采用高温热分解前驱体乙酰丙酮铁法合成了尺寸均一且分散性好的油溶性Fe3O4纳米粒子,通过表面配体置换直接将其表面换为水溶性分子聚乙二醇二酸(PEGdiacid),形成了具有表面功能基的稳定无毒的水溶性磁性复合体系。...

评级：0 浏览量：88 收藏量：0 资源大小：2.3MB 上传时间：2021-04-29

配体对CdTe量子点与BSA的选择性相互作用的影响 (2012年) 以牛血清白蛋白(BSA)作为靶分子,通过吸收光谱、荧光光谱和时间分辨荧光动力学等手段研究了各种配体分子稳定的CdTe量子点与BSA的直接相互作用.结果表明,5种量子点均能有效猝灭BSA的荧光,其猝灭程度按配体次序为GSH>L-...

评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：4.84MB 上传时间：2021-05-09

从噬菌体展示七肽肽库筛选a-淀粉酶特异性配体 (2005年) 为了建立蛋白质亲和配基的高效筛选方法，以淀粉酶为靶分子，利用交替洗脱法从七肽噬菌体展示库中筛选具有高亲和力的噬菌体配体。结果表明，交替洗脱法筛选出的特异性配体的回收率和ELISA信号值均优于酸洗脱法；采用...

评级：0 浏览量：74 收藏量：0 资源大小：795KB 上传时间：2021-05-18

以四唑为固定相配体的新型离子交换固定相的制备及色谱性能 (2008年) 用硅胶与γ-缩水甘油基丙基三乙氧基硅烷和 3-羟基丙腈反应,再采用链接化学( Click chemistry)中腈与叠氮化钠进行的 3 + 2环加成反应,合成了以四唑基为配体的弱阳离子交换色谱固定相。结果表明,所制得的色谱柱( 4.6 ...

评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：260KB 上传时间：2021-04-29

一系列非核苷HIV-1逆转录酶抑制剂的基于受体和配体的3D-QSAR研究通过比较分子场分析（CoMFA）和比较分子相似性指数分析（CoMSIA）对一系列HIV逆转录酶（RT）非核苷抑制剂（2-氨基-6-芳基磺酰基苄腈... 此外，在A环的2-位上与RT蛋白的Lys101残基建立H键的H键供体基团也对活性有利。

评级：0 浏览量：126 收藏量：0 资源大小：2.43MB 上传时间：2021-02-22

研究生第三章序列对比和数据库搜索.pptx 例如，它们可能是酶的活性位点残基，形成二硫键的半胱氨酸残基，与配体结合部位的残基，与金属离子结合的残基，形成特定结构motif的残基等等。但并不是所有保守的残基都一定是结构功能重要的，可能它们只是由于历史...

评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：7.86MB 上传时间：2022-11-21

荧光共振能量转移技术PPT学习教案.pptx 该技术是一种物理技术，用于研究受体-配基的相互作用。它可以测定受体-配基的距离、受体亲和常数、受体二聚化和受体构象变化。荧光共振能量转移技术的优点包括高灵敏度、可与许多技术结合、可以在生理条件下研究...

评级：0 浏览量：32 收藏量：0 资源大小：253KB 上传时间：2021-10-06

dr_sasa_n：生物分子的溶剂可及表面计算软件 dr-sasa是用于生物分子的溶剂可访问表面积计算软件，支持蛋白质，DNA，RNA和配体输入。输入文件可以是PDB或MOL2格式。 PDB格式文件将使用NACCESS兼容的VdW半径查找表，而MOL2格式将使用Chimera中使用的相同VdW半径...

评级：0 浏览量：463 收藏量：0 资源大小：5.27MB 上传时间：2021-02-18

Cu2+-IDA金属螯合尼龙一壳聚糖复合膜的制备及其亲和分离性能研究 (2009年) （g膜）-1，为配基的固载提供了大量活性位点。再次采用环氧氯丙烷活化复合膜，进而偶联亚氨二乙酸（IDA）、固定化Cu2+，获得金属螯合尼龙。壳聚糖复合型亲和膜，配基cu2+固载量为5.41amol?cm-2。以牛血清白蛋白为...

评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：324KB 上传时间：2021-05-19

分子对接的原理,方法及应用.docx 接着，这些小分子被逐一放置在已知三维结构的靶标分子（通常为蛋白质受体）的活性位点，通过优化小分子的位置、构象和可旋转键的角度，以及考虑受体氨基酸残基的构象，寻找两者最佳的结合状态。这个过程通常涉及计算...

评级：0 浏览量：15 收藏量：0 资源大小：57KB 上传时间：2023-03-09

生化名词解释整理.doc 【亲和层析】利用特异性配体与目标分子的结合来分离特定蛋白质。【高压液相层析】HPLC是在高压下用细颗粒介质进行的高效层析技术，用于分离复杂混合物。【凝胶电泳】凝胶电泳是基于分子大小和电荷在凝胶介质中...

评级：0 浏览量：36 收藏量：0 资源大小：48KB 上传时间：2021-10-12

原核基因表达调控PPT课件.pptx * 转录水平：DNA的结构、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。 * 转录后水平：翻译的起始、延伸及终止、蛋白质产物的加工、修饰、折叠及转运。 1.3 调控类型与特点 * 负控诱导系统 * 正控诱导...

评级：5 浏览量：42 收藏量：0 资源大小：2.23MB 上传时间：2021-10-28

光学免疫分析仪传感芯片的表面修饰及表征 (2007年) 实验结果表明，3种方案均有效地抑制了蛋白的非特异性吸附，且成功地实现了对2，4-D小分子配基的固定，其中双氨基聚乙二醇修饰的芯片基本不会吸附杂蛋白，而氨基葡聚糖修饰的芯片对2，4-D抗体具有更强的响应。...

评级：0 浏览量：23 收藏量：0 资源大小：251KB 上传时间：2021-04-26

CLONTECH酵母双杂中文版.doc 当这两种融合蛋白在酵母细胞中相遇并形成复合物时，它们可以共同激活报告基因（如 HIS3、ADE2或 LacZ），从而使酵母细胞在缺乏特定营养物质的培养基上生长或显示颜色变化。（二）单杂交实验单杂交实验则主要用来...

评级：0 浏览量：7 收藏量：0 资源大小：1.11MB 上传时间：2021-11-18

mmm:MacroMacromerecular Miner-用于无模板检测生物结构数据中亚结构保守性的框架 mmm软件使用源自数据挖掘的方法来识别结构保守的分子，并在大分子结构数据中对分离的构建基进行排序。用例在大分子结构（蛋白质/核酸）数据集中识别功能相关区域通过包括配体来表征配体结合环境分析轨迹以发现结构...

评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：1.49MB 上传时间：2021-04-30

荧光素-Fe(Ⅲ)配合物与BSA的相互作用的光谱学研究 (2013年) 研究采用荧光素一甲胺基二羧酸为配体，采用铁离子(Fe(Ⅲ))为中心金属离子，通过直接反应的合成方法，在水溶液中合成了荧光素-甲胺基二羧酸-Fe(Ⅲ)配合物．并采用紫外-可见(UV-vis)光谱和荧光(FL)光谱来研究荧光素-...

评级：0 浏览量：91 收藏量：0 资源大小：502KB 上传时间：2021-05-15