多重序列比对

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多重序列比对

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评级：0 浏览量：1392 收藏量：0 资源大小：2.5MB 上传时间：2021-04-27

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评级：0 浏览量：250 收藏量：0 资源大小：288KB 上传时间：2021-10-07

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评级：0 浏览量：268 收藏量：1 资源大小：918KB 上传时间：2021-09-18

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评级：0 浏览量：126 收藏量：1 资源大小：1.27MB 上传时间：2019-07-22

: texshade:出版物质量多重序列比对 Texshape具有很大的氨基酸着色能力，但在显示DNA比对方面受到更多限制。我添加了一个颜色包，以实现更好的DNA显示。我正在通过使该程序成为一种功能注释来欺骗该程序以通过核苷酸生成阴影。您还需要将文件复制...
评级：0 浏览量：144 收藏量：0 资源大小：1.09MB 上传时间：2021-05-07

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: 这是一款专门用于序列比对的软件。由于其序列比对显示的结果非常清楚，很多文献中的序列比对结果正是通过... DNAman是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件，几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作，包括多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。DNAMAN的速度，多...
评级：0 浏览量：224 收藏量：1 资源大小：2.75MB 上传时间：2022-05-04

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: msa_classifier:多序列比对（MSA）分类器通过在断点区域中比对序列并寻找变体“外部”和“内部”之间的过渡，可以使用多重序列比对（MSA）来解析结构变体的断点。 MSA分类器通过按列中行的相对相似度对给定MSA中的每一列进行分类，从而简化了断点解析。 ...
评级：0 浏览量：180 收藏量：0 资源大小：14KB 上传时间：2021-05-15

: cluster序列分析用于多重序列比对 clustalx1.83
评级：0 浏览量：319 收藏量：0 资源大小：502KB 上传时间：2018-08-31

: pyBoxshade：用于着色阴影序列比对的桌面应用程序用于着色/着色序列比对的桌面应用程序目的 pyBoxshade是一个程序，用于从多个蛋白质或DNA序列的比对中创建美观的打印输出。该程序本身不进行比对，它以多重比对程序或多重序列编辑器为预处理文件。该程序是...
评级：0 浏览量：222 收藏量：0 资源大小：1.04MB 上传时间：2021-02-15

: MView:提取并重新格式化序列数据库搜索或多重比对-开源 -多序列比对：CLUSTAL，HSSP，MSF，FASTA，PIR，MAF。输出：-HTML，FASTA，CLUSTAL，MSF，PIR，RDB（制表符分隔）。发现了错误？请通过以下网址在MView问题跟踪器上打开问题：...
评级：0 浏览量：270 收藏量：0 资源大小：435KB 上传时间：2021-04-29

: CONSENT:可扩展的长读自校正和多序列比对的装配抛光 CONSENT（可扩展的长读自校正和具有多个序列比对的装配抛光）是一种用于长读的自校正方法。首先，它通过计算长读段之间的重叠来工作，以便为每个读段定义对齐堆（即，用于校正的一组重叠读段）。然后，将每个读取...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：15.35MB 上传时间：2021-05-08

: 实线性和并行多重最长公共子序列（MLCS）算法为了克服它们的缺陷并解决更长，更大规模甚至更大的序列比对问题，基于提出的新颖的问题解决模型和各种策略，例如并行拓扑排序，最优计算，中间结果重用，分段计算和序列化等。，我们提出了一种新颖的并行MLCS算法...
评级：0 浏览量：242 收藏量：1 资源大小：892KB 上传时间：2021-03-06

: 基于隐马尔可夫模型的多重序列分析探讨了多重序列比对和序列谱隐马尔可夫模型，讨论了隐马尔可夫模型的基本算法以及如何建立 HMMs。根据E 值和训练分数进行蛋白质家族的识别和分类。
评级：5 浏览量：106 收藏量：1 资源大小：183KB 上传时间：2008-08-28

: 隐马尔可夫模型在多序列比对中的应用序列的多重比对是生物序列分析研究中的一个重要方法。文章首先介绍了HMM 的基本结构，然后着重讨论了HMM 在DNA 序列之间的多重比对中的应用。
评级：0 浏览量：371 收藏量：1 资源大小：104KB 上传时间：2008-08-28

: StatAlign:可扩展的统计多重比对工具。-开源 StatAlign是用于蛋白质，DNA和RNA序列的贝叶斯分析的可扩展软件包。在马尔可夫链蒙特卡洛框架中可以共同估计多个比对，系统树和进化参数，从而可以可靠地测量结果的准确性。这种方法消除了传统方法所遭受的常见伪...
评级：0 浏览量：78 收藏量：0 资源大小：5.33MB 上传时间：2021-04-29

: 生物学分析工具CLASTAL X CLUSTALX－是CLUSTAL多重序列比对程序的Windows版本。 CClustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉...
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评级：5 浏览量：118 收藏量：2 资源大小：557KB 上传时间：2012-10-12

: mPSQed:比对编辑器和多重焦磷酸测序测定设计器-开源虽然可以将PCR设计为对某些病原体具有特异性，但通常需要进行后续序列分析以进行确认或分型。适当的基于PCR的检测的设计是一项复杂的任务，尤其是当保守的区分多态性很少或需要区分的类型数量很多时。用于此目的...
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: 产甘油假丝酵母烯醇化酶基因的克隆及序列分析 (2008年) 从产甘油假丝酵母（Candida ...多重序列比对显示，产甘油假丝酵母烯醇化酶(CgENO1)含有酵母烯醇化酶全部保守区。对编码区上下游序列分析显示，克隆片段含有典型的酵母基因上下游调控区，是一个完整的酵母新基因。
评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：684KB 上传时间：2021-05-08

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: pacmonstr:长读序列数据的串联重复检测 PacmonsTR长读序列数据的串联重复检测管道按以下步骤工作：初始运行将获取一个比对文件（将长读与参考进行比对，例如hg19）和一个参考串联重复表作为INPUT，并生成一个输出文件，该文件的估计长号重复读入区域中的...
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: DeepFam:基于深度学习的蛋白质家族建模和预测的免比对方法特征免比对：不需要多重或成对序列比对来训练族模型。取而代之的是，通过卷积单元和1-max池训练家庭中局部保留的区域。卷积单元的工作方式与PSSM类似。利用可变大小的卷积单元（多尺度卷积单元）来训练通常长度...
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: Multiple Sequence Alignment 生物信息学, 多重序列比对程序. 本资源包含源代码及基本序列数据.基于跌代方法得到MSA
评级：0 浏览量：159 收藏量：0 资源大小：31KB 上传时间：2013-03-26

: 序列分析软件DNAMAN_的使用 DNAman是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件，几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作，包换多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。
评级：0 浏览量：436 收藏量：0 资源大小：337KB 上传时间：2014-08-15

: 中华鳖病原菌菌种的分离鉴定及多重PCR的初步建立 (2013年) 对患病中华鳖心脏、肝脏、肠道中分离得到的疑似致病菌株进行常规生理生化鉴定,同时采用分子生物学鉴定方法,设计细菌16s r DNA保守区通用引物,进行基因扩增及序列比对,建立并优化多重PCR反应条件.分离鉴定出4种病原菌...
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评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：63.17MB 上传时间：2021-03-06

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: RefineAlignments:一种可以细化一组多个对齐以降低全局对齐分数的工具。-matlab开发虽然工具通常可以找到最佳的成对序列比对，但对于多重比对却并非如此。 MathWorks multialign 函数使用的过程通常会提供次优解决方案。该工具可以优化多重比对以提供更优化的解决方案，但不能保证找到最佳解决方案...
评级：0 浏览量：69 收藏量：0 资源大小：399KB 上传时间：2021-05-30

: 系统发育分析系统发育（Phylogeny），也叫...将进化论的原理拓展到DNA水平和蛋白质序列水平，通过多重序列比对，研究一组相关的基因或蛋白质，推断和评估不同基因间的进化关系，其中包括分子进化（基因树）和物种进化（物种树）。
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: MSA：头脑风暴优化算法的应用-研究论文在生物信息学中，多序列比对是必不可少的。尽管已经设计了大量算法来比对序列，但对最佳多重比对的决定性估计仍然是一个挑战。在本文中，我们通过使用 BrainStorm 优化算法提出了一种有效的方法，以发现多序列...
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: VELMA-开源 VELMA代表大型多重序列比对的可视化和探索。 VELMA是一种Java工具，用于可视化超过现有软件功能的大量生物序列的比对。
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: EvolutionaryAction.jl:在 Julia 中实现进化动作此外，还需要以下 Julia 包：细节作为输入，您“仅”需要蛋白质序列的多重比对或一组此类比对。使用-p选项启动 Julia 以利用其内部并行化。 FastTree 可以使用多个线程。地位测试版在 Linux 上开发和测试（但不是...
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: 菌B49乙醛乙醇脱氢酶基因克隆中的引物设计 (2008年) 为研究乙醛乙醇脱氢酶基因及其在乙醇发酵生物制氢中的重要作用，采用clustalw对12个菌种的乙醛乙醇脱氢酶蛋白质序列进行多重比对分析，共得到6个保守区，以这6个保守区设计引物，共选用9对简并引物，命名为ADHJ1、...
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: β-甘露聚糖酶基因克隆与在大肠杆菌中表达 (2005年) 为了通过基因工程方法在大肠杆菌中发酵生产β-甘露聚糖酶,采用多重比较几种来源的β-甘露聚糖酶氨基酸序列,获得了该酶的保守结构域,并按此设计简并引物.以能水解魔芋葡甘聚糖的枯草杆菌属野生筛选菌种A33为材料,通过...
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: GenomeView-开源 GenomeView是基因组浏览器和注释编辑器，可显示参考序列，注释，多重比对，短读比对和图。支持大多数主要数据格式。可以加载本地文件和Internet文件。该项目已移至GitHub：...
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: 进化树绘制软件MEGA mega5.2 BioEdit 英文原版下载 多重序列比对软件，掐头去尾，BioEdit 进化树绘制软件MEGA mega5.2 英文原版，原版附绘图详细过程！包会！先用标准株在BioEdit里面掐头去尾对齐序列，然后直接用mage分析出结果，一步搞定！
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