分子对接软件

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分子对接软件

: 分子对接软件 MVD分子对接，简单，方便。
评级：0 浏览量：1124 收藏量：1 资源大小：15.69MB 上传时间：2016-06-27

: 分子对接软件Ledock Ledock用于对子对接的软件。用于大规模的虚拟筛选，其运行速度快。
评级：0 浏览量：986 收藏量：2 资源大小：15.06MB 上传时间：2018-09-10

: CCDC GOLD 5.3-Linux.7z CCDC GOLD Suite 5.3 linux版分子模型研究软件，分子对接模拟软件，包括安装包授权文件和补丁，补丁解压密码xiaoqq@foxmail.com GOLD has proven success in virtual screening, lead optimisation, and ...
评级：3 浏览量：974 收藏量：0 资源大小：285.84MB 上传时间：2021-05-02

: Autodock分子对接中文版.pdf Autodock是目前bioinformatics领域中常用的分子对接软件，通过它可以对蛋白质和配体进行对接，研究药物设计和蛋白质工程等领域。下面是Autodock分子对接中文版的详细知识点：一、软件安装 Autodock软件可以直接...
评级：5 浏览量：611 收藏量：0 资源大小：6.73MB 上传时间：2021-11-08

: 10分钟教你掌握分子对接模拟软件(医药向).pdf 分子对接模拟软件的基本概念和应用在药物设计和药物化学合成领域，计算机辅助药物设计（CADD）发挥着重要作用。其中，分子对接模拟是CADD的一种重要技术，通过使用计算机软件将受体蛋白与配体分子进行模拟对接，...
评级：0 浏览量：91 收藏量：0 资源大小：1.19MB 上传时间：2022-10-23

: UCSF DOCK分子对接指纹查看python脚本 plot-footprint-single-magnitude.py 配体-受体相互作用中范德华与静电能量分解的指纹footprint查看，适用于DOCK对接结果。输出指纹图片。官网链接打不开时，备用。
评级：0 浏览量：31 收藏量：0 资源大小：8KB 上传时间：2024-03-01

: mvd_win4 分子模拟对接分子模拟对接，用于个人的工作和学习。仅自己使用。
评级：0 浏览量：323 收藏量：0 资源大小：23MB 上传时间：2009-12-26

: autodock软件很棒的分子对接软件，AUTODOCK采用模拟退火和遗传算法来寻找受体和配体最佳的结合位置，用半经验的自由能计算方法来评价受体和配体之间的匹配情况
评级：0 浏览量：1372 收藏量：5 资源大小：3.51MB 上传时间：2012-11-23

: (完整word版)10分钟教你掌握分子对接模拟软件(医药向).doc (完整word版)10分钟教你掌握分子对接模拟软件(医药向).doc
评级：0 浏览量：21 收藏量：0 资源大小：976KB 上传时间：2022-11-15

: 论文研究 - 上表皮草嘌呤和一氧化氮的钌配合物的分子对接和抗利什曼原虫活性的评价使用AutoDockTools-1.5.6软件执行分子对接测试。分子靶标被认为是刚性的，而Epiruno2被认为是柔性的。对接采用的是具有全局搜索的遗传算法Lamarckian（AGL）和具有局部搜索的伪Solis和Wets。在目标蝶啶还原酶和...
评级：0 浏览量：170 收藏量：0 资源大小：4.02MB 上传时间：2020-05-13

: 对接程序autodock 分子对接软件autodock，很优秀很优秀
评级：0 浏览量：144 收藏量：1 资源大小：3.74MB 上传时间：2010-01-14

: Schrodinger软件介绍（以及Glide的工作流） 1、计算机辅助药物设计薛定谔软件； 2、虚拟筛选之分子对接； 3、Glide。
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: chimera-1.17.3-win64.exe 分子作图、处理、可视化工具Windows版本它还提供了一系列工具和功能，用于分析和比较不同分子的结构、计算物理属性以及进行分子对接和模拟等操作。除了基本的可视化和分析功能，UCSF Chimera还支持各种插件和扩展，可以根据用户的需求进行定制和扩展功能...
评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：146.19MB 上传时间：2024-03-03

: chimera1.11.2 UCSF Chimera是一款完全免费的分子模拟软件，用于分子结构和相关数据的交互可视化分析，分析数据包括密度图，超分子组合，顺序排列，对接结果等，可以生成图像和动画。
评级：0 浏览量：274 收藏量：0 资源大小：8KB 上传时间：2019-04-02

: 分子作图、处理、可视化工具chimera-1.17.3-linux-x86-64.bin，Linux版本它还提供了一系列工具和功能，用于分析和比较不同分子的结构、计算物理属性以及进行分子对接和模拟等操作。除了基本的可视化和分析功能，UCSF Chimera还支持各种插件和扩展，可以根据用户的需求进行定制和扩展功能...
评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：148.32MB 上传时间：2024-03-03

: 基于分子对接的洋葱假单胞茵脂肪酶催化制备 R- N(2-甲基-6-乙基苯基)丙氨酸的分子机制 (2013年) 通过将立体电子效应的构象约束条件引入计算机分子对接中，在Autodoek4．2软件中筛选到不同烷基链长的(R，S)-NEMPA与 BCL活性口袋合适的反应型构象，对实验数据进行了合理解释；基于能量最优、空间互补原则，预测了...
评级：0 浏览量：32 收藏量：0 资源大小：1.33MB 上传时间：2021-05-13

: rDock:快速的开源程序，用于将配体对接至蛋白质和N.Acids-开源 rDock是一种快速且通用的开源对接程序，可用于将小分子与蛋白质和核酸对接。它是专为高通量虚拟筛选（HTVS）活动和绑定模式预测研究而设计的。 rDock主要用C ++编写，附件脚本和程序用C ++，perl或python语言编写。...
评级：0 浏览量：527 收藏量：0 资源大小：1.61MB 上传时间：2021-04-29

: 蛋白质分子表面高质量网格构建技术的研究进展分子表面即分子边界,在一定程度上蕴含了分子的生物化学属性信息,对分子表面进行分析将有助于理解分子对接、识别和相互作用等问题。由于蛋白质分子表面的构造相对复杂,尤其是分子表面的网格化,因此寻求高效的算法构建...
评级：0 浏览量：56 收藏量：0 资源大小：273KB 上传时间：2021-03-09

: UCSFChimera(分子结构可视化软件)V1.13.1英文免费安装版 UCSF Chimera是一款专门用于分子结构模拟的工具，软件支持分子结构和相关数据的交互可视化分析，分析数据包括密度图，超分子组合，顺序排列，对接结果等，可以生成图像和动画，需要的朋友可以前来本站下载。...
评级：0 浏览量：688 收藏量：0 资源大小：141.88MB 上传时间：2019-08-03

: pymol教程-生物大分子显示软件生物大分子显示软件使用说明，简介；便于大家快速，正确掌握使用该软件
评级：0 浏览量：1704 收藏量：3 资源大小：4.05MB 上传时间：2009-12-26

: UCSFChimera(分子结构可视化软件)V1.13.1linux最新免费版 UCSF Chimera linux版是一款linux系统上运行的专门用于分子结构模拟的工具，软件支持分子结构和相关数据的交互可视化分析，分析数据包括密度图，超分子组合，顺序排列，对接结果等，可以生成图像和动画，需要的朋友...
评级：0 浏览量：565 收藏量：0 资源大小：152.6MB 上传时间：2019-08-03

: MOLS 2.0-开源 Gautham，MOLS 2.0：用于肽建模和蛋白质配体对接的软件包，分子建模杂志 22 (2016) 1-9。与 MOLS 2.0 相关的出版物： 1. Vengadesan, K. & Gautham, N. 使用相互正交的拉丁方对分子势能表面进行增强采样：应用于肽...
评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：65.27MB 上传时间：2021-05-31

: molecular docking 当前评价较高的一款分子对接软件。对接算法、对接速度都优于许多对接软件，推荐使用。有一个应用程序是用于本机ID码识别的，用于今后的license申请。将得到的ID码发给官方邮件即可获得软件所需的license。
评级：0 浏览量：142 收藏量：3 资源大小：14.34MB 上传时间：2010-04-11

: 国内计算化学方法与软件开发.docx 计算化学在国内的发展迅速，研究领域已涵盖了分子模拟和优化、量子化学计算、分子对接等方面。国内学者在计算化学方法的研究上取得了一系列重要成果，如发展了基于密度泛函理论、哈密顿力学等方法的计算模型，应用于...
评级：0 浏览量：23 收藏量：0 资源大小：13KB 上传时间：2023-09-29

: AutoShim-开源通过PLS回归，迭代训练和姿势选择来建立分子对接活性预测模型的工具。描述符包括（i）对接得分，（ii）药效团特征，（iii）决策树学习的多特征描述符。
评级：0 浏览量：17 收藏量：0 资源大小：46.79MB 上传时间：2021-04-27

: rDock Reference Guide.pdf 开源分子对接软件rDock的用户指南文档。rDock可以实现蛋白-配体，RNA-配体的分子对接，也可以用于高通量虚拟筛选，可以在对接过程中加入药效团限定，提高虚拟筛选的命中率。适用于部署在单机或者HPC用于虚拟筛选。
评级：0 浏览量：24 收藏量：0 资源大小：863KB 上传时间：2024-02-17

: 蛋白质间分子动力学模拟及数据分析PPT学习教案.pptx * 蛋白质对接是指将两个蛋白质分子结合在一起的过程 * 蛋白质对接可以使用Zdock，GRAMM，Hex等软件进行 * 蛋白质对接可以预测蛋白质之间的相互作用二、模拟所需软件和文件 * NAMD：执行模拟的软件 * Ambertools：...
评级：0 浏览量：77 收藏量：0 资源大小：363KB 上传时间：2021-10-05

: GPCR-Bench:GPCR-Bench提供了高质量的GPCR对接基准测试集 GPCR-Bench提供了高质量的GPCR对接基准测试集：截至2015年1月，共有25种PDB结构涵盖了所有NR结构，以及DUD精神下的活性和诱饵化合物。如何使用为您选择的GPCR目标下载文件，或下载所有文件以比较所有25个GPCR目标...
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: echecs是一款个人基于obEspoir框架开发的多人自定义麻将该麻将和传统的各类app地方麻将不同，其能够最大化... echecs是一款个人基于obEspoir框架开发的多人自定义麻将，该麻将和传统的各类app地方麻将不同，其能够最大化支持人数、牌花色、胡牌玩法等各类自定义配置，以类分子的规则思路尽量使用一套服务端代码可以适配出几十...
评级：0 浏览量：24 收藏量：0 资源大小：9.35MB 上传时间：2024-04-15

: 基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA2抑制剂 (2013年) 运用Autodock分子对接软件,分析短肽与sPLA2的相互作用,通过pH动态监测法验证其抑制活性。设计得到的CPGV肽可以与sPLA2的疏水性活性中心结合,该四肽对蛇毒sPLA2的活性抑制率为69.12%。通过生物信息学和分子
评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：1.03MB 上传时间：2021-04-28

: 计算机辅助药物设计.pptx 5. 分子对接：使用Autodock、FlexX、Affinity软件，进行分子对接。计算机辅助药物设计的优点包括： 1. 提高药物设计的效率和准确性。 2. 降低药物设计的成本。 3. 提高药物设计的创新性。计算机辅助药物设计的...
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: pyrx使用教学提纲.pdf PyRx 是一个基于 Autodock 和 Vina 的虚拟筛选工具，用于分子对接。下面是 PyRx 使用教学提纲的知识点：一、Autodock 安装和使用 * 安装 Autodock 需要一步一步按照网上的详细步骤进行，否则可能会出现问题 * ...
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: autodock中文版使用说明.pdf AUTODOCK 4.0 是一套做 docking 的软件，主要是做小分子与大分子(receptor)键结的预测。下面是 AUTODOCK 4.0 的使用说明：一、准备工作 1. 安装 AUTODOCK 4.0 软件，并安装四项程序：PS。 2. 打开 AUTODOCK 4.0 ...
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: awesome-protein-folding:蛋白质折叠很棒。将您的教科书扔进垃圾桶，点燃垃圾桶着火，将骨灰倒入您的冷冲... 深度学习蛋白质折叠视频 -Prospr-开源实现 分子对接工具探索两个或多个分子结构如何配合的工具一套自动对接工具，旨在预测小分子如何与已知3D结构的受体结合与AutoDock相比，大大提高了绑定模式预测的平均准确性...
评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：13.7MB 上传时间：2021-04-02

: GPT-4再掀AI研发热潮，从CADD到AIDD药物「智造」进展如何？下表列举了CADD常用的对接软件。表1 常用CADD对接工具列表注：增量构建是一种药物发现的方法，即通过添加与目标蛋白契合度高的片段，一步步构建药物分子。这种方法可以减少搜索空间，提高寻找最佳候
评级：0 浏览量：309 收藏量：0 资源大小：1.3MB 上传时间：2023-04-23

: Autok_4.2_官方使用教程中文版(Bioms小组翻译)Autok4.2借鉴.pdf 为了解决这一问题，很多对接软件简化了对接的步骤。Autodock 通过两种方法的结合使用解决了以上的问题：快速的基于格点能量的计算方法（rapid grid-based energy evaluation）和有效的扭转自由度搜索方法（efficient...
评级：0 浏览量：28 收藏量：0 资源大小：1.54MB 上传时间：2021-12-25

: 专业工具autodock 原创-AutoDock使用札记（1） AutoDock在2.0以前使用的是模拟退火算法（Simulated Annealing ...AutoDock虽然提供了诸如ADT(AutoDock Tools)，BDT的图形界面工具，但是我们仍然认为其是一个字符界面运行的分子对接软件
评级：1 浏览量：198 收藏量：0 资源大小：527KB 上传时间：2012-11-14

: deepchem-gui:DeepChem的简单Web GUI 到目前为止，它可以使用在PDBBind上DeepChem模型来预测配体与蛋白质的对接。 GUI非常依赖于分子可视化库和化学信息库。目录：要求安装从源安装是当前唯一支持的格式。按照此处的说明安装DeepChem。安装...
评级：0 浏览量：268 收藏量：0 资源大小：33.98MB 上传时间：2021-05-04

: GSK-3抑制剂药效团模型的构建 (2012年) 采用Accelrys Discovery Stutio Client 2．5软件，筛选得到由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水中心、1个环芳香性和1个排除体积组成的最佳模型(Correl=0．900，Config=13．962， Acost=90．725)，采用测试集与分子...
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: 角鲨烯合成酶抑制剂的高通量虚拟筛选 (2012年) 以SQS抑制剂CP-320473为先导物,在60%结构相似性的基础上,先通过AutoDock Vina软件进行分子对接,再选取结合能量最低的新化合物进行分子对接研究.结果表明:zinc_8442249比先导化合物CP-320473的抑制效果更好;SQS活性...
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: 南极假丝酵母脂肪酶B催化3 (4 氟苯基)戊二酸酐不对称醇解 (2015年) 2软件将过渡态底物与CALB进行对接,根据对接自由能差异解析了CALB催化3 FGA与不同醇反应的立体选择性差异,得到的S型底物结合能小于R型底物;其次,基于扭转角机制分析发现,S型底物扭转角小于R型底物,从分子水平上揭示...
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: 肝素与HIV-1膜表面蛋白gp120相互作用的预测和模拟 (2004年) 用分子模拟软件研究肝素与HIV-1膜表面蛋白gp120的相互作用。...用肝素六糖片段和结合区域进行反应分子对接，获得两种结合模式。最终建立的模型能够很好地解释肝素体外抑制HIV-1的现象，同时对其机理进行了推测。
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: mgltools_win32_1.5.6_Setup.exe 在使用AutoDock分子对接程序之前需要通过分子对接图形化软件MGLTools软件处理好相应的文件。在使用AutoDock做对接需要使用到的文件主要有配体分子和受体分子的pdbqt文件，生成Grid的gpf文件，做对接的dpf文件，而...
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: 基于人芳香酶的雄甾烷衍生物抗乳腺癌构效关系研究 (2012年) 为研究以雄甾烷衍生物作为人芳香酶抑制剂的构效关系,以ZINC数据库中80%相似性的5045种类似结构化合物为配体,利用蛋白质晶体数据(3EQM)通过Sybyl软件中的SurFlex模块进行分子对接虚拟筛选并打分,得到分值在8.0分以上...
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: 论文研究 - 不同比例的壳聚糖和聚乙烯吡咯烷酮对pH敏感的水凝胶的行为和建模分析收集结果后，为了以视觉方式理解现象，还使用Avogadro软件详细阐述了分子模型。因此，可以认识到壳聚糖在水凝胶中的比例越大，其对pH的敏感性越大。这种特性与其结构中的氨基（-NH2）有关，能够进行质子化和去...
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: uscfdock6.4_官方教程 分子对接软件dock6.4可以用于大规模的虚拟筛选，也可用于小分子库的精细筛选，包括刚性和柔性对接，这里是的官方教程，英文版
评级：0 浏览量：525 收藏量：1 资源大小：3.21MB 上传时间：2011-01-04

: AutoDock中文教程 AutoDock是一套用来自动分子对接的软件，可以预测小分子是如何与已知三维结构的受体结合的。AutoDock包含两套程序：AutoDock表现的是配基如何栅格化的蛋白对接；AutoGrid则用来计算这些格栅。在进一步利用它们对接时...
评级：3 浏览量：1014 收藏量：2 资源大小：1.67MB 上传时间：2010-10-31

: autodock中文教程一款用于分子模拟的软件使用指南，分子对接模拟，蛋白模拟
评级：0 浏览量：758 收藏量：0 资源大小：560KB 上传时间：2013-01-29

: moe 使用说明此文档告诉我们如何使用moe软件，如其分子画图，对接等功能
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