autodock-vina

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: autodock-vina及视频教程.rar autodock-vina在autodock的基础上开发，实现了多线程任务模式，提高了运算速度，同时给大家提供了一个简单的官网教学视频供大家使用。
评级：0 浏览量：1792 收藏量：1 资源大小：6.91MB 上传时间：2020-05-19

: AutoDock-Vina：AutoDock Vina AutoDock Vina：对接和虚拟筛选程序 AutoDock Vina是最快，使用最广泛的开源对接引擎之一。它是一个交钥匙的计算对接程序，它基于简单的评分功能和快速的梯度优化构象搜索。它最初是由分子图形实验室的Oleg Trott...
评级：0 浏览量：1660 收藏量：2 资源大小：25.92MB 上传时间：2021-02-13

: AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock 关于 OpenCL和Cuda加速版的AutoDock4.2.6。它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。 OpenCL版本是与TU-Darmstadt合作开发的，...
评级：5 浏览量：1115 收藏量：1 资源大小：18.19MB 上传时间：2021-02-21

: autodock vina 软件 autodock vina软件，非常好用，计算起来也很方便!!!!!!
评级：4 浏览量：3139 收藏量：3 资源大小：500KB 上传时间：2018-01-18

: AutoDock Vina 1.1.2 - 64-bit:针对x86_64系统CentOS 6.7的AutoDock Vina 1.1.2的编译。-开源利用Oleg Trott博士的AutoDock Vina 1.1.2的开源代码，提供了vina和vina_split的有效二进制文件。对于不太熟悉在Linux机器上构建源代码的人，这些文件可能会有所帮助。由于在超级计算机上对某些系统配置进行更改后...
评级：0 浏览量：699 收藏量：0 资源大小：6.6MB 上传时间：2021-05-27

: Autodock Vina 批量分子对接 Autodock vina 批量分子对接，Slurm 调度器
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: AutoDock/vina PyMOL插件的使用 AutoDock/vina PyMOL插件的使用
评级：5 浏览量：1081 收藏量：3 资源大小：1.01MB 上传时间：2014-05-15

: 利用python实现Autodock Vina多对多分子对接结果筛选并绘制热图大家注意一下，我的热图代码里面用的是txt文件中倒数第10行的数据，如果你的txt对接结果中有这句话"Writing output ... done."。需要用记事本把py文件打开，把这句 for i in f.readlines()【-10】，改成for i in f....
评级：0 浏览量：4415 收藏量：12 资源大小：2KB 上传时间：2022-01-16

: Autodock.rar Autodock的使用说明，有英文版的，Autodock的各种应用以及中文版的
评级：0 浏览量：178 收藏量：0 资源大小：5.09MB 上传时间：2010-09-26

: dockit：使用Vina系列引擎与多个目标和配体进行高通量分子对接使用AutoDock Vina系列引擎执行与多个目标和配体的高通量分子对接。 :gem_stone: 产品特点同时与多个靶标和配体进行分子对接。灵活的目标残留声明。使用其他类似Vina的引擎，例如或。随MGLTools分发的原始...
评级：5 浏览量：1135 收藏量：1 资源大小：20KB 上传时间：2021-02-09

: AutoDock 4.2 官方使用教程(中文版) AutoDock 4.2 官方使用教程中文版（Bioms小组翻译）对于蛋白质对接使用软件，对于信息工程方面应用很广使用。
评级：0 浏览量：3556 收藏量：6 资源大小：888KB 上传时间：2014-07-22

: dockingbox:基于 Biojava 的实用程序，用于根据氨基酸和原子位置选择... 用于 iDock、Autodock Vina 等工具用于 iDock、Autodock Vina 等工具。要使用该工具，只需实例化阅读器并输入要放置边界框的 PDBID、链和残基（位置） PDBReader reader = new PDBReader(); double[] box = PDBStructureUtils.getBoundingBox...
评级：0 浏览量：115 收藏量：0 资源大小：725KB 上传时间：2021-06-17

: autodock使用简介这是我的学生编辑的，最好在linux下的openoffice下阅读。
评级：0 浏览量：336 收藏量：1 资源大小：887KB 上传时间：2009-10-20

: 结合区口袋的体积影响AutoDock Vina虚拟筛选的准确性结合区口袋的体积影响AutoDock Vina虚拟筛选的准确性，陈旭栋，曹洋，基于结构的虚拟筛选是一项利用分子对接技术从大量候选的化合物分子文库中对受体靶点蛋白的潜在抑制剂进行大规模筛选的高效率计算
评级：0 浏览量：578 收藏量：1 资源大小：311KB 上传时间：2020-02-22

: raccoon_fox_tutorial.pdf 使用Raccoon进行autodock Vina的虚拟筛选说明书。其中，raccoon用于虚拟筛选，Fox用于筛选后的数据分析
评级：0 浏览量：144 收藏量：1 资源大小：235KB 上传时间：2020-04-22

: gendock:用于虚拟筛选生成的或现有的小分子至大分子的Python软件包创建一个包含rdkit tensorflow numpy autodock-vina git clone https://github.com/philspence/gendock.git cd gendock mkdir receptors cp path/to/receptor.pdbqt receptors/receptor.pdbqt 运行GenDock ...
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: AUDocker-开源 AUDocker是AutoDock Vina的GUI。帮助连续不断地虚拟筛选大量配体。帮助在意外关闭时恢复工作。
评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：6KB 上传时间：2021-04-27

: pyrx使用教学提纲.pdf PyRx 是一个基于 Autodock 和 Vina 的虚拟筛选工具，用于分子对接。下面是 PyRx 使用教学提纲的知识点：一、Autodock 安装和使用 * 安装 Autodock 需要一步一步按照网上的详细步骤进行，否则可能会出现问题 * ...
评级：0 浏览量：34 收藏量：1 资源大小：120KB 上传时间：2023-06-12

: ParallelVSR:ParallelVSR - R 平台上并行虚拟筛选的管道-开源我们集成了使用 ChemmineR 的基于配体的虚拟筛选 (LBVS) 技术 - R 平台上可靠的化学信息学包和基于结构的虚拟筛选 (SBVS) 技术，它使用 AutoDock Vina - 免费提供且广泛使用的蛋白质配体对接工具。此管道具有 ...
评级：0 浏览量：120 收藏量：0 资源大小：15KB 上传时间：2021-06-29

: (NCS) NEQUIM Contact System:分析配体-蛋白质复合物中相互作用的工具-开源 NEQUIM Contact System（NCS）是一个用于生成和分析蛋白质-配体复合物相互作用载体的系统。核心功能包括向量的多个视图，多个... 输入可以来自PDB格式，也可以来自自动对接软件AutoDock / Vina或Surflex生成的文件。
评级：0 浏览量：165 收藏量：1 资源大小：8.56MB 上传时间：2021-04-30

: PSOVina 2.0:蛋白质配体对接的混合粒子群优化-开源一个基于粒子群智能... 在最初的 PSO 实现的基础上，我们的 PSOVina 方法经历了几项重要的改进，与原始 AutoDock Vina 相比，提高了对接精度并实现了显着的效率。 https://cbbio.online/software/psovina/index.html
评级：0 浏览量：118 收藏量：0 资源大小：156.78MB 上传时间：2021-05-31

: DoTS:目标系统对接接口（将一个分子与多个目标对接的程序） AutoDock Vina- 自动对接工具套件用于异步任务的 Celery 和 django-celery（在后台停靠） RabbitMQ - 消息系统 ChemDoodle Web - javascript 化学库，处理化学结构的显示和绘制 Flot - 用于绘图的 jQuery 插件 ...
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: 10分钟教你掌握分子对接模拟软件(医药向).pdf 使用 PyRx 软件可以进行分子对接模拟，通过调用 Autodock Vina 算法，计算受体蛋白与配体分子的结合能大小。然后，使用 AutodockTools 对结果进行可视化和分析。五、结果分析通过分子对接模拟，筛选出具有理想...
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: 角鲨烯合成酶抑制剂的高通量虚拟筛选 (2012年) 以SQS抑制剂CP-320473为先导物,在60%结构相似性的基础上,先通过AutoDock Vina软件进行分子对接,再选取结合能量最低的新化合物进行分子对接研究.结果表明:zinc_8442249比先导化合物CP-320473的抑制效果更好;SQS活性...
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