多基因座序列分析

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多基因座序列分析

: 论文研究 - 根瘤菌伴有多位点序列分析 在这项研究中，使用多基因座序列分析（MLSA）分析与羽扇豆和大豆相关的根瘤细菌之间的系统发育关系。在分析的17种细菌菌株中，有13种从羽扇豆根瘤中分离出来。从美国农业部国家根瘤菌种质资源库获得。另外，检查...
评级：0 浏览量：108 收藏量：0 资源大小：3.02MB 上传时间：2020-05-31

: strataG:strataG是用于单倍体序列和多基因座遗传数据摘要以及种群结构分析的工具包 strataG是用于单倍体序列和多基因座遗传数据摘要以及种群结构分析的工具包。可以使用标准R'['标引方法选择特定的个体，基因座或地层。。该软件包包含用于汇总单倍体和二倍体基因座的功能（例如，等位基因丰富性，...
评级：0 浏览量：80 收藏量：1 资源大小：1.73MB 上传时间：2021-04-28

: SPANDx:单倍体下一代基因组序列数据的比较分析-开源 SPANDx将原始NGS读数与您选择的参考基因组或全基因组进行比对，然后进行准确的变体调用和注释，以及基因座的存在与否确定。 SPANDx产生SNP和indel矩阵，用于下游系统发育分析。如果指定，也可以识别带注释的全基因...
评级：0 浏览量：163 收藏量：0 资源大小：46.01MB 上传时间：2021-04-29

: 河南汉族人群4个Y-STR基因座及单倍型遗传多态性分析 (2009年) 采用PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA序列分析河南汉族102名无血缘关系、健康男性个体的4个Y―STR基因座基因及单倍型频率分布。结果显示：4个基因座共发现了24个等位基因，频率分布在O。0098～O。7745。102个...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：342KB 上传时间：2021-05-31

: 论文研究 - 基于DNA-AuNPs和双酶双信号扩增的多甲基化基因座分析电化学生物传感器在这里，我们提出了一种超灵敏的电化学生物传感器，用于通过锚定金纳米颗粒（DNA-AuNPs）和双酶双信号放大的DNA定量分析DNA序列中的多个甲基化基因座。在生物传感器的DNA-AuNPs捕获了目标DNA后，甲基CpG结合蛋白...
评级：0 浏览量：619 收藏量：0 资源大小：2.27MB 上传时间：2020-05-15

: 论文研究 - 一些辣椒的分子多样性分析共检测到五个多态性SSR基因座的10个等位基因，每个引物平均2.00个等位基因。基因多样性范围从0.333到1.00，平均为0.567。 SSR引物的多态信息含量（PIC）值介于0.255至0.500之间，平均值为0.371。相似度指标矩阵的...
评级：0 浏览量：117 收藏量：0 资源大小：752KB 上传时间：2020-05-30

: physcraper:基因树更新使用树和单个基因座比对来查找和添加同源序列，以改善和推进群体中的系统发育推断。正在积极开发该工具。如果您需要任何帮助或有反馈，请发布GitHub问题或联系。这是代码库。有关使用Anaconda或Virtualenv ...
评级：0 浏览量：91 收藏量：0 资源大小：26.47MB 上传时间：2021-04-08

: RGT:重复基因分型工具-开源用于来自靶向测序读数的简单序列重复结构的免比对基因分型软件简单序列重复结构通常使用靶向测序进行基因分型，其中产生来自同一基因座的数千个序列读数。然后将这些读数与代表样品中可能存在的所有可能重复结构的...
评级：0 浏览量：92 收藏量：0 资源大小：37.75MB 上传时间：2021-06-01

: zzu算法设计与分析实验报告 T2：新冠状病毒的基因序列 T3：单调递增最长子序列 T1：拦截导弹 T2：分弹珠 T5：矩阵取数游戏 T2：汽车加油问题 T3：会场安排问题 T4：程序存储问题 T1：自然数拆分问题 T2：自然数拆分的方案数 T3：子集和...
评级：0 浏览量：361 收藏量：9 资源大小：1.6MB 上传时间：2023-04-06

: bacannot:用于原核基因组注释的通用管道它用：用于通用注释rRNA预测的用于在多基因座序列类型（ST）中进行分类的 for KO批注用于绘制KO注释用于甲基化注释用于基因组浏览器生产的注释合并用于绘制基因组岛用于抗菌基因注释的，，和数据库，和用于...
评级：0 浏览量：118 收藏量：0 资源大小：1.41MB 上传时间：2021-03-07

: 中华绒鳌蟹Eriocheirsinensis两个地理种群的微卫星DNA多态性分析 (2006年) 采用微卫星DNA分型技术,对江苏地区两个地理种群(本地种与荷兰种)的中华绒鳌蟹共计140个样本,通过DNA提取,PCR扩增、聚丙烯酞胺凝胶电泳、银染检测的方法,进行了两个微卫星基因座(Esin67和Esin87)的遗传多态性分析。...
评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：4.08MB 上传时间：2021-05-16

: kSNP:kSNP从整个基因组中进行SNP发现和SNP注释-开源 SNP基因座由围绕中央SNP等位基因的长度为k的寡核苷酸定义。 kSNP可以分析已装配重叠群或原始，未装配读数中的完整（完成）基因组和未完成基因组。可以将完成的和未完成的基因组一起分析，并且kSNP可以自动下载完成...
评级：0 浏览量：1075 收藏量：0 资源大小：127.01MB 上传时间：2021-04-29

: 论文研究 - 遗传微卫星标记的开发，验证和表征设计了针对100个基因座的特异性引物，其中32种为多态性，其多态性信息含量值范围为0.12至0.81（平均0.54）。扩增的微卫星区域每个位点平均产生4.44个等位基因（范围为1到13）。尽管转移的基因座数目有所不同，但...
评级：0 浏览量：91 收藏量：0 资源大小：505KB 上传时间：2020-05-30

: 长散布的核元素（LINEs）中的逆转录酶片段的鉴定和表征。 序列分析表明rt片段高度异质且富含A / T碱基。序列同一性为31.8％至99.4％。基于序列相似性，将rt片段分为八组。此外，在同一组克隆中，相似的终止密码子分布模式表明它们经历了相似的进化过程。有趣的是，对从...
评级：0 浏览量：122 收藏量：0 资源大小：1.33MB 上传时间：2020-06-03

: Micro_salmonella_infantis_newport_typhimurium_genomics:肠道沙门氏菌谱系I的三种血清型的人群基因组计划使用基于层次的种群结构分析来映射全基因组以进行基因座发现和性状预测在每个血清群中鉴定新的隐藏变体或潜在的生态型方法计算平台ProkEvo用于处理末端成对的Illumina原始序列，以产生以下输出：核心基因组比对，...
评级：0 浏览量：82 收藏量：0 资源大小：176KB 上传时间：2021-04-01

: 论文研究 - 欧洲森林树木菌根中的二氢脂酰脱氢酶同工酶的隶属关系和Matt Bolete酶的特性在两棵落叶树的根组织中，醋酸纤维素电泳后可以看到两个基因位点，而在两个针叶树种的根组织中表达了三个基因座。这两种真菌和另外的外生菌根真菌仅表达一个二氢脂酰脱氢酶基因。在Peroinatus X. and Badius中，...
评级：0 浏览量：116 收藏量：0 资源大小：9.53MB 上传时间：2020-05-27

: 论文研究 - 规律性散布的短回文重复序列（CRISPR）与分离自医疗废物和环境水的细菌菌株的抗生素耐药性模式... 因此，在对这些细菌分离株进行了各种生化和分子分析后，对CRISPR基因座进行了研究。细菌分离物的鉴定是通过基于聚合酶链反应（PCR）的16S rDNA分析来进行的，这些DNA从那些分离的菌株中提取。结果表明，大多数...
评级：0 浏览量：145 收藏量：0 资源大小：867KB 上传时间：2020-05-27

: FastMLST::high_voltage::dna:FastMLST 快速MLST 多核多基因座序列分型工具，结合等位基因串联。介绍FastMLST是用Python3编写的高速独立脚本，它采用FASTA格式的程序集（也允许压缩），并根据定义的MLST方案确定其ST。与其他ST确定程序相比，主要优点是...
评级：0 浏览量：104 收藏量：1 资源大小：27KB 上传时间：2021-03-07

: 紫外照射对潜血指纹DNA检验的影响利用3130XL遗传分析仪研究了不同客体上的潜血指纹经过紫外照射后对于DNA-短串联重复序列（STR）分型图谱的影响。结果表明，渗透性客体上潜血...在等量时间的紫外照射下，随着浓度的稀释，能够检出的基因座数逐渐减少。
评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：2.61MB 上传时间：2021-02-09

: 论文研究 - 新型微卫星标记的开发和表征基于使用转录组分析的RNA序列，为紫苏物种开发了37个新的简单序列重复（SSR）引物组。这些新的SSR标记用于分析15种紫苏种的遗传多样性。在37个基因座中总共确认了182个等位基因，平均每个基因座4.9个等位基因，每...
评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：236KB 上传时间：2020-05-17

: QTL-seq:QTL-seq流水线，以鉴定造成表型的致病突变，2013）中实施的散装分离剂分析是一种强大而有效的方法，可用于识别农作物中具有重要农学意义的基因座。从MutMap改编了QTL-seq以识别定量性状基因座。它利用从两个具有极端相反性状（例如抗性vs易感性）的分离后代...
评级：0 浏览量：204 收藏量：0 资源大小：49.62MB 上传时间：2021-03-19

: Bacterial_Genome_Analysis_Toolbox 确定细菌WGS数据集（物种内和物种间）的核心和辅助基因座 产生核心基因串联比对确定潜在的重组区域（最近和祖先）从细菌基因组的保守区域鉴定SNP 整体工作流程安装在本地计算机上安装conda 制作工作目录 mkdir...
评级：0 浏览量：75 收藏量：0 资源大小：32KB 上传时间：2021-04-05

: MIRA:RNA突变的突变鉴定 MIRA通过将序列划分为长度为n的短kmer窗口（默认值：7），对沿基因基因座的显着突变区域（SMR）进行无偏搜索。计算方法基于二项式检验，并针对局部核苷酸偏倚进行了进一步校正。后来，如此获得的重要的kmers与...
评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：20.5MB 上传时间：2021-05-09

: UCE_phyluce_pipeline:UCE生物信息学管道在本教程中，我将提供示例数据，并带您完成读取处理，序列组装，基因座匹配的读取和序列比对的步骤，最后提供一些可以对UCE数据进行的系统发育分析的示例。内容目录结构和示例文件在本教程中，我将使用Linux机器...
评级：0 浏览量：194 收藏量：0 资源大小：351KB 上传时间：2021-03-26

: MGEScan-开源 MGEScan-non-LTR是一种软件，用于根据通用隐马尔可夫模型（GHMM）启发的计算方法，识别基因组序列中的非LTR反转录转座子。参考文献：1. M. Rho等人，“从头鉴定真核生物基因组中的LTR反转录转座子”，BMC Genomics...
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