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MIMIC-IV介绍文档,使用笔记 包括对各模块,表格及表格内字段的介绍,以及在使用中遇到的一些值得注意的问题 部分内容可见https://blog.csdn.net/weixin_46523923/article/details/121994699
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MIMIC-IV
2022.6.12 更新 MIMIC-IV_V2.0,更新内容在结尾
一些基本逻辑
病人定义:
subject_id
每个患者有唯一的 subject_id
hadm_id
患者的每一次入院会有一个唯一的 hadm_id
transfer_id
患者每一次更换病房会有一个唯一的 transfer_id
stay_id
在相同类型病房内进行转移,则会更新一个 transfer_id,但会有相同的 stay_id,例如用
ICU 中的一个病房转移到另一个病房,则 stay_id 不变,transfer_id 更新。
所有 id 的分配都是随机的,与时间先后无关。
date and time
后缀为 date 的,分辨率最低为天;后缀为 timed 的字段,分辨率最低为分钟。
charttime and storetime:分别是测量的记录时间与储存时间。通常以 charttime 为准
d and icd
命名为 d_开头,为编码表。d_icd 开头,为 icd 编码表。icd 结尾的表,为使用 icd 编码的记
录表。
Tables
分为六个模块,Core、Hosp、ICU、ED、CXR、Note
Core
Core 模块包含患者跟踪数据。这里描述了人口统计、入院信息和住院病房转院情况
admission
患 者 入 院 信 息 , 以 每 次 入 院 为 单 位 记 录 , 每 条 记 录 有 一 个 单 独 的
hadm_id , hospital_expire_flag 只 当 次 住 院 是 否 院 内 死 亡 , 部 分 院 内 死 亡 患 者 没 有
deathtime,可能是数据库本身的问题。

patient
患者信息
Name data type Description
subject_id INTEGER
gender VARCHAR(1)
性别
anchor_age INTEGER
第一次入院年龄(若年龄小于 18,则设置为
0;大于 89 岁,则设置为 91)
anchor_year INTEGER
第一次入院年
anchor_year_group VARCHAR(255)
大约真实的入院时间
dod TIMESTAMP(0)
死亡时间(院内死亡时间与 admission 表相
同,但包含部分院外死亡时间,参考意义不
大)
transfers
病房转移信息
Name data type Description
Name data type Description
subject_id INTEGER
患者 id
hadm_id INTEGER
住院 id
admittime TIMESTAMP(0)
入院时间
dischtime TIMESTAMP(0)
出院时间
deathtime TIMESTAMP(0)
死亡时间
admission_type VARCHAR(40)
按入院紧迫性分为 9 种
admission_location VARCHAR(60)
入院来源
discharge_location VARCHAR(60)
出院去向
insurance VARCHAR(255)
保险
language VARCHAR(10)
语言
marital_status VARCHAR(80)
婚姻
ethnicity VARCHAR(80)
种族
edregtime TIMESTAMP(0)
进急诊时间
edouttime TIMESTAMP(0)
出急诊时间
hospital_expire_flag SMALLINT
是否在住院期间内死亡,1 为在入院期间内死
亡

subject_id INTEGER
hadm_id INTEGER
transfer_id INTEGER
eventtype VARCHAR(10)
转移事件描述
careunit VARCHAR(255)
病房类型
intime TIMESTAMP(0)
转入时间
outtime TIMESTAMP(0)
转出时间
Hosp
Hosp 模块涵盖的信息包括实验室测量,微生物学,药物管理,和收费诊断等
d_icd_diagnoses
包含国际疾病分类(ICD)第 9 版和第 10 版的诊断代码
Name data type Description
icd_code VARCHAR(10) ICD
编码
icd_version INTEGER ICD
版本
long_title VARCHAR(300)
诊断名称
diagnoses_icd
患者诊断信息表。seq_num 代表诊断的优先级,序号越靠前越重要,而低优先级的排序有
时并不准确。
有情况一个 Hadm_id 对应有两套诊断,一套使用 icd-9,一套使用 icd-10,本质上相同,
取一套使用即可
Name data type Description
subject_id INTEGER
hadm_id INTEGER
seq_num INTEGER
诊断顺序
icd_code CHAR(7)
诊断编码
icd_version INTEGER
编码版本
drgcodes
也是与诊断相关的表,使用 Diagnosis Related Group(DRG) code.编码,与 diagnose 表中的主
要诊断相对应。
https://www.findacode.com/code-set.php?set=DRG
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feiGeorge
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