MIMIC-IV文档介绍及使用笔记.docx
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MIMIC-IV介绍文档,使用笔记 包括对各模块,表格及表格内字段的介绍,以及在使用中遇到的一些值得注意的问题 部分内容可见https://blog.csdn.net/weixin_46523923/article/details/121994699 MIMIC-IV(Medical Information Mart for Intensive Care IV)是一个公开可用的重症监护单元(ICU)数据库,用于医学研究。它包含了丰富的临床数据,如患者人口统计信息、入院记录、实验室测试、药物使用、诊断和图像数据。这个数据库被广泛用于医疗数据分析、机器学习模型的开发和验证。 在MIMIC-IV的最新版本2.0中,有以下几个关键知识点: 1. **患者标识**:每个患者有一个唯一的`subject_id`,这是患者在数据库中的唯一身份标识。`hadm_id`则对应患者每次入院的唯一标识,而`transfer_id`用于区分患者在同一种类型的病房间转移的事件。`stay_id`则是在同一病房类型内的转移,即使患者从一个ICU病房转移到另一个ICU病房,`stay_id`保持不变,但`transfer_id`会更新。 2. **日期和时间**:字段后缀为`date`的表示日期,精度到天;后缀为`time`的表示时间,精度到分钟。`charttime`是记录事件的实际时间,而`storetime`是数据存储的时间。在分析时,通常以`charttime`为准,因为它反映了临床操作的时间。 3. **编码表**:以`d_`开头的表表示编码表,如`d_icd`表示ICD编码表。以`icd`结尾的表记录使用ICD编码的数据。 4. **核心模块(Core)**:包含了患者的基本信息,如人口统计、入院和病房转移情况。`admission`表记录每次入院的详细信息,包括`hospital_expire_flag`标记是否在医院内死亡。`patient`表包含患者的基本信息,如`anchor_age`表示首次入院时的年龄,`dod`是死亡时间。 5. **病房转移信息(Transfers)**:`transfers`表记录了患者在医院内部的移动,包括入院、出院、死亡时间和转移事件的描述。此外,还有入院类型、来源、去向、保险、语言、婚姻状况、种族、急诊时间等信息。 6. **Hosp模块**:涵盖了实验室测试、微生物学、药物管理和诊断等数据。`d_icd_diagnoses`表列出了ICD编码及其对应的诊断名称。`diagnoses_icd`表记录了患者的诊断信息,包括诊断的优先级和ICD编码版本。 7. **诊断和疾病分类**:`drgcodes`表关联了诊断的诊断相关组(Diagnosis Related Group, DRG),这是一种用于医保报销和医疗资源管理的分类系统。 8. **其他模块**:除了Core和Hosp,MIMIC-IV还包括ICU、ED(急诊室)、CXR(胸部X光)和Note(病历注释)模块,分别提供了更专业的数据,如重症监护的详细生理指标、急诊处理信息、影像学结果和医生的病历记录。 在使用MIMIC-IV时,需要注意数据的隐私保护和合规性,因为这涉及到患者敏感信息。研究者应遵循数据使用协议,并确保数据的匿名化处理。同时,由于数据可能存在缺失或不一致,分析时需谨慎处理这些问题,以确保研究结果的准确性。对于遇到的问题,可以通过社区论坛或已发布的使用笔记获取解决方案。
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