### CRISPR-Cas9基因编辑技术步骤方法详解 #### 一、CRISPR-Cas9技术概述 CRISPR-Cas9系统是一种源自微生物的核酸酶系统,它在微生物中发挥着防御噬菌体和质粒侵袭的作用。CRISPR位点包括一系列与CRISPR相关的(Cas)基因以及非编码RNA元件,这些元件能够编程CRISPR介导的核酸切割的特异性。利用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑时,通过将哺乳动物密码子优化的Cas9核酸酶与单导向RNA(sgRNA)共同表达于哺乳动物细胞内,可以实现对基因组的精确编辑(Shalem*, Sanjana*, et al., Science 2014)。本文将详细介绍如何构建LentiCRISPR v2和lentiGuide-Puro载体用于基因编辑。 #### 二、LentiCRISPR v2载体构建步骤 LentiCRISPR v2载体是一个包含两个表达盒的系统:人源化Cas9(hSpCas9)和嵌合导向RNA。该载体可以通过BsmBI酶切,并将一对互补寡核苷酸克隆到单导向RNA支架中。设计这些寡核苷酸序列时需基于目标位点的20bp序列,并在其3'端加上一个3bp的NGG PAM序列。 **步骤1:选择目标基因** 确定需要编辑的目标基因及其特定位置。这一步骤非常重要,因为错误的目标基因可能导致非预期的结果。 **步骤2:设计sgRNA** 根据目标基因位点设计sgRNA序列。sgRNA的长度通常为20bp,其后应紧跟着PAM序列(NGG),这是Cas9识别并切割DNA的关键序列。 **步骤3:合成寡核苷酸** 根据设计好的sgRNA序列合成相应的寡核苷酸。寡核苷酸通常需要进行退火处理以形成双链结构。 **步骤4:载体线性化** 使用限制性内切酶BsmBI消化LentiCRISPR v2载体,从而将其线性化,为后续插入sgRNA序列做准备。 **步骤5:连接寡核苷酸** 将退火后的寡核苷酸连接到线性化的载体上。这一步骤通常通过连接酶完成。 **步骤6:转化细菌** 将连接产物转化至感受态细菌中,筛选阳性克隆。 **步骤7:测序验证** 提取阳性克隆中的质粒,并通过测序验证sgRNA序列是否正确无误。 #### 三、lentiGuide-Puro载体构建步骤 lentiGuide-Puro载体仅表达嵌合导向RNA,并不包含Cas9。因此,在使用该载体之前,需要先使用另一个载体(如lentiCas9-Blast)将Cas9整合到目标细胞系中。与LentiCRISPR v2类似,lentiGuide-Puro也可以通过BsmBI酶切,并将一对互补寡核苷酸克隆到单导向RNA支架中。设计这些寡核苷酸序列时同样需基于目标位点的20bp序列,并在其3'端加上一个3bp的NGG PAM序列。 **步骤1:Cas9整合** 使用lentiCas9-Blast载体将Cas9整合到目标细胞系中。这一步骤确保了Cas9的存在,使得lentiGuide-Puro能够发挥功能。 **步骤2-6:同LentiCRISPR v2** 从设计sgRNA到测序验证的步骤与LentiCRISPR v2相同。 #### 四、LentiCRISPR v2与lentiGuide-Puro选择指南 - **LentiCRISPR v2**:适用于初次构建或需要较高病毒滴度的情况。 - **lentiGuide-Puro**:适用于已经整合有Cas9的细胞系,能产生更高的病毒滴度。 #### 五、总结 CRISPR-Cas9基因编辑技术是当前生物学研究领域的一项重大突破,为基因功能研究和疾病治疗提供了新的可能性。通过详细掌握LentiCRISPR v2和lentiGuide-Puro载体构建的具体步骤,研究人员可以更有效地应用这一技术来实现基因编辑的目的。
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