NetAvg:网络平均脚本

平均脚本 安装要求： 正在工作并最新安装python，ProDy和networkx 点安装 pip安装networkx 对于do_minimization.py，可运行gromacs 4.5。 脚本 所有轨迹应为多帧PDB格式。 cartesian_average.py trajectory.pdb average.pdb 将轨迹的所有帧迭代叠加到平均值上，然后输出所有重原子的笛卡尔平均值。 find_centroid.py trajectory.pdb centroid.pdb 按照Cartesian_average.py计算平均值，然后从最接近该平均值的轨迹输出帧。 network_average.py --cutoff 1.0 trajectory.pdb average.pdb 计算NetAvg的轨迹。 在我们的基准测试集上，最好使用1.0的临界值。 do_mi