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buscomp:总线补偿
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2021-05-07
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BUSCOMP:BUSCO编译和比较工具 BUSCOMP v0.11.0 为了更好地呈现和导航此文档,请访问或下载并打开 。 也可以通过使用dochtml=T选项运行BUSCOMP来生成文档。 (必须安装R和pandoc-参见下文。) 介绍 BUSCOMP旨在克服BUSCO在以下方面的不确定性限制: 从一组程序集中编译一组完整的非冗余最大BUSCO,并且 使用该集合可对具有可预测行为的同一基因组不同组装之间的完整性进行“真实”比较。 对于每个BUSCO基因,BUSCOMP将使用full_table_*.tsv结果表和命中序列的single_copy_busco_sequences/目录从可用序列中提取最佳的“单完成”序列。 BUSCOMP通过Score对所有程序集中的所有命中进行排名,并保持排名最高的命中。 然后按长度解析关系,并保持最长的顺序。 得分和长度的平局将保留任意条目作为获胜
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buscomp:总线补偿 (101个子文件)
MBG344WTDBG2.N3.paf.cmd 128B
SGDR64.2.1.N3.paf.cmd 126B
chrIIIdup.N3.paf.cmd 125B
MBG344001.N3.paf.cmd 125B
example.genomes.csv 353B
yeast.groups.csv 161B
example.groups.csv 80B
yeast.buscomp.faa 999KB
yeast.buscomp.fasta 2.53MB
MBG344001.fsa 11.71MB
MBG344WTDBG2.fsa 11.66MB
SGDR64.2.1.fsa 11.6MB
chrIIIdup.fsa 679KB
.gitattributes 194B
.gitignore 1KB
yeast.N3L20ID0U.full.html 8.23MB
yeast.N3L20ID0U.html 2.89MB
index.html 1.08MB
buscomp.docs.html 1.08MB
index.html 1.05MB
yeast.buscomp.fasta.index 32KB
SGDR64.2.1.fsa.index 542B
MBG344WTDBG2.fsa.index 408B
MBG344001.fsa.index 353B
chrIIIdup.fsa.index 24B
test.ini 158B
example.ini 136B
buscomp.ini 18B
LICENSE 34KB
yeast.log 37KB
buscomp.log 840B
README.md 50KB
BUSCOMP.md 50KB
QUICKSTART.md 4KB
MBG344WTDBG2.N3.input.md5 53B
chrIIIdup.N3.input.md5 53B
SGDR64.2.1.N3.input.md5 53B
MBG344001.N3.input.md5 53B
MBG344WTDBG2.N3.paf 391KB
MBG344001.N3.paf 386KB
SGDR64.2.1.N3.paf 384KB
chrIIIdup.N3.paf 40KB
buscomp.py 310KB
rje.py 273KB
rje_seqlist.py 254KB
rje_uniprot.py 228KB
rje_paf.py 183KB
rje_db.py 136KB
rje_sequence.py 106KB
rje_obj.py 104KB
rje_disorder.py 58KB
rje_html.py 37KB
rje_forker.py 31KB
rje_zen.py 29KB
rje_rmd.py 28KB
rje_scoring.py 20KB
rje_menu.py 11KB
rje_py2.py 4KB
rje_py3.py 4KB
tidybusco4.py 4KB
tidybusco.py 4KB
buscomp.docs.Rmd 50KB
yeast.N3L20ID0U.full.Rmd 36KB
yeast.N3L20ID0U.Rmd 28KB
test.sh 577B
yeast.full.tdt 433KB
SGDR64.2.1.N3L20ID0U.hitsum.tdt 277KB
MBG344001.N3L20ID0U.hitsum.tdt 277KB
MBG344WTDBG2.N3L20ID0U.hitsum.tdt 277KB
MBG344WTDBG2.N3L20ID0U.local.tdt 272KB
MBG344001.N3L20ID0U.local.tdt 269KB
SGDR64.2.1.N3L20ID0U.local.tdt 268KB
chrIIIdup.N3L20ID0U.hitsum.tdt 248KB
SGDR64.2.1.N3L20ID0U.gablam.tdt 200KB
MBG344001.N3L20ID0U.gablam.tdt 184KB
MBG344WTDBG2.N3L20ID0U.gablam.tdt 169KB
SGDR64.2.1.N3L20ID0U.hitunique.tdt 136KB
SGDR64.2.1.N3L20ID0U.qryunique.tdt 136KB
yeast.N3L20ID0U.buscomp.tdt 122KB
MBG344001.N3L20ID0U.qryunique.tdt 120KB
MBG344001.N3L20ID0U.hitunique.tdt 120KB
yeast.buscoseq.tdt 111KB
yeast.busco.tdt 109KB
MBG344WTDBG2.N3L20ID0U.hitunique.tdt 108KB
MBG344WTDBG2.N3L20ID0U.qryunique.tdt 107KB
yeast.N3L20ID0U.unique.tdt 50KB
yeast.N3L20ID0U.changes.full.tdt 40KB
chrIIIdup.N3L20ID0U.local.tdt 32KB
chrIIIdup.N3L20ID0U.gablam.tdt 10KB
chrIIIdup.N3L20ID0U.hitunique.tdt 6KB
chrIIIdup.N3L20ID0U.qryunique.tdt 3KB
yeast.genomes.tdt 2KB
yeast.N3L20ID0U.rdata.tdt 1KB
yeast.N3L20ID0U.changes.tdt 478B
yeast.N3L20ID0U.ratings.tdt 320B
yeast.N3L20ID0U.gain.tdt 143B
example_busco3.tgz 4.26MB
full_table_SGDR64.2.1.tsv 113KB
full_table_MBG344001.tsv 98KB
full_table_MBG344WTDBG2.tsv 80KB
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信徒阿布
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