transrate-tools:读取bam文件并汇总有关序列的读取映射信息

转换工具 用于处理bam文件的命令行工具。 用C ++编写并使用Bamtools。 建造 transrate-tools使用C ++ 11功能，因此您至少需要安装g ++ 4.7。 在OSX上，您可以使用brew install gcc49安装最新的gcc。 请注意，在OSX上，您始终需要使用选项-DCMAKE_CXX_COMPILER=$(which g++-4.9)来告诉cmake在哪里可以找到gcc。 确保使用子模块克隆： $ git clone --recursive git@github.com:cboursnell/transrate-tools.git 并且您将需要安装cmake。 接下来，构建bamtools： 在Linux上： $ cd bamtools $ mkdir build $ cd build $ cmake .. $ make $ cd ../..