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sambamba:用于处理SAMBAM数据的工具
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2021-05-06
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[ ] 桑巴姆巴 目录 获得帮助 报告sambamba错误或问题 检查清单: 行为守则 编译Sambamba 编译依赖 为Linux编译GNU Guix 为Mac OS X编译 发展 调试和故障排除 某些英特尔至强处理器上的段错误 转储核心 使用catchsegv 使用gdb 执照 信用 介绍 Sambamba是用D编程语言编写的高性能,高度并行,健壮且快速的工具(和库),用于处理SAM和BAM文件。 由于其高效性,Sambamba是当今世界许多测序中心运行的重要工作马。 截至2020年11月,Sambamba已被引用超过450次,并且已从Conda安装超过18万次。 Sambamba也由Debian发行。 当前功能是samtools功能的重要子集,包括视图,索引,排序,标记和深度。 大多数工具都支持管道:只需将/dev/stdin或/dev/stdout为文件名即可。 当我
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sambamba:用于处理SAMBAM数据的工具 (212个子文件)
LGPL-2.1 26KB
sambamba-view.1 5KB
sambamba-sort.1 3KB
sambamba-markdup.1 2KB
sambamba-pileup.1 2KB
sambamba-flagstat.1 1KB
sambamba-index.1 1KB
sambamba-merge.1 1KB
sambamba-slice.1 1KB
sambamba.1 902B
issue_204.bam.bai 80KB
mate_overlaps_1_3M_4M.bam.bai 3KB
issue_193.bam.bai 256B
issue225.bam.bai 96B
issue_204.bam 38KB
mate_overlaps_1_3M_4M.bam 30KB
issue_193.bam 5KB
issue225.bam 4KB
match_mates.bam 1KB
mate_overlaps_1_3M_4M.bed 89B
chr2_chr3_test_region.bed 88B
meson.build 3KB
msgpack.d 135KB
fastrecordparser.d 103KB
stream.d 89KB
read.d 56KB
recordparser.d 43KB
markdup.d 42KB
depth.d 42KB
doformat.d 40KB
pileup.d 35KB
samheader.d 33KB
pileup.d 26KB
header.d 25KB
parser.d 23KB
baseinfo.d 22KB
sort.d 21KB
tagvalue.d 20KB
reader.d 20KB
queryparser.d 18KB
alignment.d 18KB
reader.d 18KB
inputstream.d 18KB
merge.d 17KB
randomaccessmanager.d 16KB
maq.d 15KB
samheadermerger.d 14KB
subsample.d 14KB
reconstruct.d 14KB
multireader.d 14KB
bgzf.d 14KB
slice.d 14KB
view.d 13KB
pratt_parser.d 13KB
indexing.d 13KB
lz4.d 11KB
filtering.d 11KB
writer.d 10KB
flowcall.d 10KB
format.d 10KB
fasta.d 9KB
cigar.d 9KB
tinymap.d 8KB
zlib.d 8KB
outputstream.d 8KB
pileup.d 8KB
base.d 8KB
bgzf_writer.d 8KB
unstablesort.d 7KB
range.d 7KB
reference.d 7KB
block.d 7KB
memoize.d 7KB
reader.d 7KB
cstream.d 6KB
sequence.d 6KB
baifile.d 6KB
readrange.d 6KB
decompress.d 6KB
region.d 6KB
stream.d 6KB
flagstat.d 5KB
parse.d 5KB
mergesort.d 5KB
fai.d 5KB
bed.d 5KB
reader.d 5KB
bylinefast.d 5KB
alignmentrangeprocessor.d 5KB
fastq.d 4KB
index.d 4KB
algo.d 4KB
intervaltree.d 4KB
readstorage.d 4KB
value.d 4KB
main.d 4KB
compress.d 4KB
readrange.d 4KB
writer.d 4KB
array.d 4KB
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梦小露
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