seq-format-conversion:在序列数据格式之间转换的工作流程

序列格式转换 在序列数据格式之间转换的工作流程 补习班： 此脚本应将 CRAM 转换为 SAM 到 BAM，并输出 BAM、BAM 索引和验证报告。 之所以选择这种方法，而不是直接使用 Samtools 将 CRAM 转换为 BAM，是因为由于软件包中包含旧版本的 htslib，Samtools 1.3 会生成不正确的 bin。 Samtools 1.4 和 1.5 版有一个 NM 问题，导致它们无法使用 Picard 进行验证。 要求/期望 临时文件 输出 Bam 文件和索引 验证报告 配对-fastq-to-unmapped-bam ： 此 WDL 将成对的 FASTQ 转换为 uBAM 并添加读取组信息 要求/期望 FASTQ 格式的双端测序数据（每个方向一个文件） 每个样本的以下元数据描述符： 阅读组 样品名称 图书馆名称 平台单元 运行日期 平台名称 sequecing_