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Biscap and cfdr:对齐后snp调用和验证的脚本-开源
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2021-05-27
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用于使用比对预测错误率(BiSCaP)的二项式概率从比对确定纯合和杂合位置的脚本,以及对该方法和其他比对/ SNP调用方法(cFDR)的准确性进行基准测试的方法
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Binomial-SNP-caller-v0.11.tar.gz (49个子文件)
Binomial-SNP-caller-v0.11
.DS_Store 6KB
Cumulative_Binomial_Probabilities_for_0.1.tab 3.59MB
BiSCaP.pl 30KB
Binomial_Probabilities_for_0.01.tab 3.39MB
test.pileup 2KB
._.DS_Store 82B
test.reference.fasta 4KB
.git
logs
HEAD 181B
refs
heads
master 181B
remotes
origin
master 149B
info
exclude 250B
index 1KB
COMMIT_EDITMSG 29B
objects
a6
bdf846118284cb5b562062c592b83c7fb1aba1 463B
pack
0a
0278aead2dae7e858394f9c440656854c03192 1.08MB
1d
831a256090b3401341ff0ab7d3c4a5ac9c1105 1.14MB
info
7e
bee0c7930b35e1ae421481a9b4e3013778b258 2KB
11
b2fe88af79f6be55820c89540bd42e62c85181 4KB
9b
e4566f26adce4997a16cd0f9dfd15d64a156f1 1.19MB
dd
3bb208652c8d042ecfa30f476aa20df0516261 904B
72
13a20692c00f321f3da17a1fa2fd2e0063ab48 655B
76
080942e199a073b00d090a9c628548b2230998 1.04MB
6b
186dc2630f340bbd38800198e0577dd15547c7 9KB
f6
a411195c9ef2acf0ef4152ce53d96c6d47ef86 2KB
7f
f9a27b4dc88d72dc165217781999a70dbddf4d 6KB
ec
d9d2f2e7a5ace0d3b4832b74e0f1c8cc435d7c 1KB
49
886b2a888d72c31a1676a0db046afcbede4206 143B
37
ca8bf4908394bbab02a1bac6e7d7aa17e2febf 3KB
HEAD 23B
config 307B
refs
heads
master 41B
tags
remotes
origin
master 41B
branches
hooks
pre-applypatch.sample 398B
commit-msg.sample 896B
pre-commit.sample 2KB
applypatch-msg.sample 452B
prepare-commit-msg.sample 1KB
update.sample 4KB
post-update.sample 189B
pre-rebase.sample 5KB
description 73B
check_test_VCF.pl 12KB
Binomial_Probabilities_for_0.1.tab 3.59MB
GBiD.pl 12KB
Cumulative_Binomial_Probabilities_for_0.01.tab 3.39MB
IRMS.pl 11KB
ASCII.pm 4KB
README 6KB
CFDR.pl 17KB
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