VAMPseq:我们通过大规模并行测序（VAMP-seq）开发了变异体丰度，该变异体同时测量了数千个错义变异体对蛋白质细胞内丰度...

VAMPseq 该存储库中包含重新创建VAMP-seq手稿所需的分析词所需的文件。 R Markdown文件“ VAMP-seq_analysis.Rmd”旨在与R Studio一起运行。 要运行此脚本，请将这四个文件放在同一目录中： “ PTEN_variant_data.tsv” “ TPMT_variant_data.tsv” “ PTEN_positional_data.tsv” “ TPMT_positional_data.tsv” 此外，请创建一个名为“输出”的目录，该目录将包含手稿中包含的绘图的图像文件。 值得注意的是，一旦运行，此R Markdown还将在“输出”目录中创建一系列“ .pml”文件。 可以将这些“ .pml”文件加载到PyMOL中，以使用覆盖在PTEN和TPMT晶体结构上的VAMP-seq丰度得分开始交互式会话。 TPMT / PTEN蛋白变异丰