Translatome-Neurodevo：通过神经发育追踪核糖体参与

介绍 在基于干细胞的神经元分化过程中，通过并行的TRAP-seq和RNA-seq实验估算的核糖体参与分析代码和数据。 查找了解详细信息。 数据 在笔记本中运行代码之前，请解压缩压缩数据。 首先，连接数据块： cd /downloaded_github_folder/data cat data.tar.gz.part_ * > data.tar.gz 然后，解压缩： tar -xzf data.tar.gz 运行R笔记本所需的数据在data文件夹中完全可用。 R笔记本 Estimate_RE.Rmd 从TRAP-seq和RNA-seq计算核糖体结合。 应用分位数归一化来校正复制之间的缩放比例偏差。 获得重复之间的统计数据用于下游分析。 analytics_RBPs.Rmd 发现具有高和低核糖体参与的mRNA中3'UTR中RBP结合元件的富集。 binding_elements文