pyensembl:Python界面可访问Ensembl的参考基因组特征（例如基因，转录本和外显子）

PyEnsembl PyEnsembl是一个Python接口，用于参考基因组元数据（例如外显子和转录本）。 PyEnsembl从Ensembl FTP服务器下载和文件，并将它们加载到本地数据库中。 PyEnsembl还可以使用通过用户提供的GTF和FASTA文件指定的自定义参考数据。 用法示例 from pyensembl import EnsemblRelease # release 77 uses human reference genome GRCh38 data = EnsemblRelease ( 77 ) # will return ['HLA-A'] gene_names = data . gene_names_at_locus ( contig = 6 , position = 29945884 ) # get all exons associated with HLA-