illumina-SNPchip-strand-normalizer:将“-”链基因型转化为“+”链基因型，以消除与参考基因组的...

illumina SNP芯片链归一化器 illumina 的 SNP 芯片可产生 + 和 - 链基因型。 为了进一步分析，这种混合链基因型应该标准化。 该模块根据每个illumina SNP芯片的清单文件将全链基因型转换为+链基因型。 考试用法 如果您想打印 SNP 芯片中所有探针的链度，请首先从下载您感兴趣的 SNP 芯片的清单文件。 在您感兴趣的 SNP 芯片的“产品文件”部分下下载清单文件（CSV 格式）。 将所有探针的链数打印为下面的检查代码。 from illumina_SNPchip_strand_normalizer import * manifest = illuminaSNPmanifest ( 'manifest file path' ) for probeID in manifest . getProbeID (): print probeID , str