没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
Illumina-pipeline
共23个文件
py:15个
no_matches:1个
dockerfile:1个
需积分: 10 1 下载量 177 浏览量
2021-03-28
08:49:22
上传
评论
收藏 35KB ZIP 举报
温馨提示
该存储库包含用于解释和分析Illumina测序数据的代码。 在此目录中创建一个“输出”文件夹,其中包含每个处理过的样品的生成图和读取的CSV文件。 入门: 要运行这些脚本,您需要能够运行python,perl,bowtie2和awk。 Mac / Linux 对于mac / linux,这仅意味着 ,任何最新版本都可以使用,并将提取的文件夹添加到PATH环境变量中。 其他应该已经存在于您的系统中。 视窗 对于Windows,你需要 ,下载bowtie2拉链标记mingw和Binaries压缩。 将bowtie2和gawk下载的文件夹放在将来不需要移动或删除它们的地方。 此外,对于Windows计算机,应确保它们位于完整目录路径中,且没有空格。 因此,如果您的用户名包含空格(例如C:\ Chris Acree \ important_downloads),请不要将bowtie2和ga
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
Illumina-pipeline-master.zip (23个子文件)
Illumina-pipeline-master
pipeline
plasmid_plot.py 8KB
trans_dist_plot.py 14KB
utils.py 3KB
fingerprinting.py 3KB
plotting.py 7KB
__init__.py 0B
read_aligner.py 11KB
read_raw_files.py 3KB
main.py 3KB
plotting
plasmid_plot.py 8KB
trans_dist_plot.py 16KB
genome_plot.py 6KB
test.py 227B
inputs
experiment_info.csv 1KB
Dockerfile 409B
ingestion.sh 1KB
__init__.py 0B
requirements.txt 111B
.gitignore 90B
parameters.py 2KB
README.md 4KB
awk_commands
yes_matches 12B
no_matches 27B
共 23 条
- 1
资源评论
钟离舟
- 粉丝: 42
- 资源: 4665
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功