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RATTLE:纳米Kong长序列测序的转录组的无参考重建和错误校正
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cpp:7个
hpp:7个
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2021-05-04
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响尾蛇 长时间测序的转录组的无参考重建和定量 要求 具有C ++ 14支持的GCC 安装 克隆存储库 git clone --recurse-submodules https://github.com/comprna/RATTLE 建立响尾蛇 cd RATTLE ./build.sh 正在运行“ RATTLE” 警告所有命令和参数仍处于试验阶段,并可能在将来的版本中进行更改 样例命令 每个命令的详细信息都可以在下面找到,但是这些是运行RATTLE时最常用的一些命令。 簇cDNA纳米Kong具有24条线在基因水平上读取 $ ./rattle cluster -i reads.fq -t 24 -o . --fastq 簇cDNA纳米Kong具有24条线在同工型水平上读取 $ ./rattle cluster -i reads.fq -t 24 --fastq --iso 簇RNA纳米Ko
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RATTLE-master.zip (21个子文件)
RATTLE-master
main.cpp 17KB
.gitignore 93B
README.md 6KB
build.sh 116B
fasta.hpp 439B
.gitmodules 137B
argagg.hpp 47KB
cluster.cpp 9KB
correct.cpp 20KB
LICENSE 34KB
misc
ss_check.py 14KB
utils.hpp 598B
fasta.cpp 2KB
spoa
kmer.cpp 4KB
cluster.hpp 946B
hps
Makefile 897B
similarity.hpp 385B
similarity.cpp 3KB
utils.cpp 2KB
correct.hpp 1KB
kmer.hpp 1KB
共 21 条
- 1
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syviahk
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