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Molecular_Dynamics_and_Free_Energy_Perturbation:分子动力学和自由能微扰
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FEP分析v1.0 作者: Nour Aldin Kahlous和以色列Cabeza de Vaca Lopez 电子邮件: 地点:乌普萨拉大学Jens Carlsson实验室日期: 2020-2021 说明:全面的MD / FEP分析 笔记: 安装方式 fepanalysis工具包仅需三个简单的步骤即可安装: 1-下载并安装conda(anaconda或minicoda): wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.03-Linux-x86_64.sh 2-创建并激活Python 3.7.4环境: conda create --name py37 python=3.7.4 conda activate py37 3-下载并安装FEP分析工具包: git clone https://github.com/nou
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Molecular_Dynamics_and_Free_Energy_Perturbation-main
MANIFEST.in 18B
.vscode
settings.json 69B
deprecated
Hysterseis.py 1KB
TI_Calculation.py 4KB
test.py 239B
Extract_traj.py 3KB
Energies_and_Temprature.py 2KB
Probability_Density_Function.py 2KB
RMSD_qclac.py 4KB
Reading_Q_energies.py 7KB
test_fepanalysis
test_fepanalysis.py 16B
LICENSE 1KB
setup.py 1KB
README.md 1KB
.gitignore 32B
fepanalysis
estimators.py 16KB
inout
Q.py 16KB
__init__.py 0B
__pycache__
Q.cpython-37.pyc 13KB
__init__.cpython-37.pyc 195B
commands.cpython-37.pyc 1017B
commands.py 868B
__init__.py 0B
feptool.py 3KB
tools.py 753B
__pycache__
plots.cpython-37.pyc 8KB
feptool.cpython-37.pyc 2KB
estimators.cpython-37.pyc 12KB
tools.cpython-37.pyc 186B
__init__.cpython-37.pyc 189B
Parsing_Computing_Q_energies.py 43KB
plots.py 8KB
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