ikra:RNAseq管线以鲑鱼为中心

ikra v1.2.3-以Salmon为中心的RNAseq管道 从实验矩阵自动创建基因表达表（基因×样品）。 该输出可用作的输入。 伊克拉（Ikra）是一条以为中心的RNAseq管道。 请注意，必须在本地安装sra-tools。 这取决于NCBI的工具升级。 请安装sra-tools（> = 2.10.7）。 用法 Usage: ikra.sh experiment_table.csv species \ [--test, --fastq, --help, --without-docker, --udocker --protein-coding] \ [--threads [VALUE]][--output [VALUE]]\ [--suffix_PE_1 [VALUE]][--suffix_PE_2 [VALUE]] args