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sentieon-dnaseq:Sentieon DNAseq
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2021-05-31
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已弃用。 更新的基准可在 将 GATK 生殖系管道的结果与 Sentieon 匹配 介绍 本文档描述了 Sentieon DNAseq 管道匹配不同版本的 GATK 生殖系管道的功能。 如果您有任何其他问题,请访问或通过Sentieon Inc. 的技术支持。 输入和参考 NA12878的Fastq文件是从FTP站点下载的: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/NA12878/NIST_NA12878_HG001_HiSeq_300x/140127_D00360_0011_AHGV6ADXX/Project_RM8398/ Hg38 和其他数据库是从 GATK 资源包下载的。 请参见此处: : 参数 文件 法斯塔 Homo_sapiens_assembly38.fasta known_Mills Mills_and_1
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sentieon-dnaseq-master
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gatk4.0.sh 10KB
Sentieon_match_3.8_4.0.sh 4KB
Sentieon_match_4.1.sh 4KB
README.rst 18KB
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gatk3.8.sh 10KB
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ZackRen
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